145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0043 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  96.5 
 
 
286 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  33.45 
 
 
293 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  33.09 
 
 
287 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  34.81 
 
 
314 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  31.71 
 
 
277 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  31.58 
 
 
309 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  34.78 
 
 
289 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  32.38 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  31.82 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  34.33 
 
 
305 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  33.93 
 
 
308 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  28.76 
 
 
305 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  31.22 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  31.22 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  31.58 
 
 
310 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  27.27 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  30.2 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  31.64 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  27.9 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  27.38 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  28.75 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  29.25 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  31.4 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  30.17 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  29 
 
 
306 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  26.58 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  27.71 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  27.71 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  29.52 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  27.27 
 
 
306 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  27.27 
 
 
306 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  27.27 
 
 
306 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  27.16 
 
 
318 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  28.21 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  27.62 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  26.98 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  27.27 
 
 
306 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  28.72 
 
 
302 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  28.51 
 
 
308 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  27.9 
 
 
308 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  25.72 
 
 
321 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  28.69 
 
 
295 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  28.51 
 
 
305 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  26.24 
 
 
305 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  28.82 
 
 
303 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  26.5 
 
 
307 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  28.74 
 
 
295 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  27.76 
 
 
307 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  28.14 
 
 
303 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  27.51 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  26.86 
 
 
303 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  27.2 
 
 
309 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  28.35 
 
 
310 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 
303 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  27.97 
 
 
308 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  30.34 
 
 
295 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  29 
 
 
306 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  29 
 
 
306 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  27.43 
 
 
325 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  29.61 
 
 
307 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  32.22 
 
 
314 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  29.61 
 
 
323 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  28.21 
 
 
300 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  32.22 
 
 
314 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  32.08 
 
 
315 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  27.46 
 
 
299 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  29.18 
 
 
306 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.07 
 
 
308 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  27.95 
 
 
299 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  29.82 
 
 
298 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  27.93 
 
 
304 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  28.33 
 
 
306 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  27.12 
 
 
300 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  28.76 
 
 
297 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  24.89 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  27.51 
 
 
303 aa  99  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  27.95 
 
 
299 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  30.47 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  29.9 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  26.8 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  27.71 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  25.73 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  28.69 
 
 
321 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  28.38 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  28.38 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  31.35 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  28.38 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  26.61 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  28.38 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  28.38 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>