More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0014 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  771    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  99.46 
 
 
371 aa  767    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  40.11 
 
 
410 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  40.67 
 
 
429 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  40.69 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  40.69 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  40.69 
 
 
405 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  40.4 
 
 
405 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  40.4 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  41.97 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  41.97 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  41.97 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  41.97 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  41.97 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  41.97 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  41.97 
 
 
390 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  40.11 
 
 
405 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  42.02 
 
 
390 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  39.58 
 
 
389 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  41.35 
 
 
387 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  42.38 
 
 
382 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  38.72 
 
 
412 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  42.69 
 
 
379 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  42.12 
 
 
390 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  40.74 
 
 
378 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  38.89 
 
 
399 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  40.97 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  38.44 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  38.16 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  40.47 
 
 
403 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  40.95 
 
 
378 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  37.6 
 
 
417 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  39.39 
 
 
384 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  37.01 
 
 
378 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  38.76 
 
 
377 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  40.35 
 
 
386 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  40.46 
 
 
386 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  41.48 
 
 
385 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  37.93 
 
 
423 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  36.36 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  38.48 
 
 
387 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  39.61 
 
 
391 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  37.91 
 
 
420 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  37.91 
 
 
420 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  40.48 
 
 
374 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  37.47 
 
 
418 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  40.12 
 
 
384 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  38.98 
 
 
417 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  37.54 
 
 
427 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  37.46 
 
 
382 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  35.84 
 
 
399 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  38.64 
 
 
379 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  37.83 
 
 
386 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  39.88 
 
 
390 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  35.86 
 
 
400 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  35.29 
 
 
387 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  39.36 
 
 
394 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  33.53 
 
 
385 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  35.29 
 
 
379 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  35 
 
 
379 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  35.48 
 
 
379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  33.52 
 
 
341 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.62 
 
 
763 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.29 
 
 
765 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  33.24 
 
 
341 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  33.43 
 
 
341 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  33.24 
 
 
356 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  33.93 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  32.29 
 
 
365 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  32.14 
 
 
357 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 
777 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  31.05 
 
 
339 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.51 
 
 
334 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.36 
 
 
757 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.36 
 
 
757 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.36 
 
 
757 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 
757 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.36 
 
 
757 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.36 
 
 
757 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 
757 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.33 
 
 
757 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  33.46 
 
 
376 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  32.06 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  31.18 
 
 
375 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  28.21 
 
 
347 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  30.19 
 
 
341 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30.26 
 
 
349 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  28.45 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  25.38 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  32.22 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  31.27 
 
 
357 aa  96.3  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  28.09 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  26.43 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  28.47 
 
 
350 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  29.89 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  31.43 
 
 
377 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  27.91 
 
 
358 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  26.87 
 
 
348 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  28.63 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  28.09 
 
 
362 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>