281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2641 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  58.73 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  68.63 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  71.11 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  71.11 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  60.34 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  66.67 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  64.71 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  71.11 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  57.14 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  71.11 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  49.21 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  52.38 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  63.04 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0470  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.835953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  64.44 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  50.88 
 
 
65 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  60.42 
 
 
65 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  68.89 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  65.96 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  65.96 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  53.97 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  59.62 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  52.38 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  63.83 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  62.5 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>