94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2487 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  713    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  62.88 
 
 
332 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  61.37 
 
 
369 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  57.83 
 
 
340 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  54.71 
 
 
331 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  53.44 
 
 
334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  48.8 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  52.74 
 
 
344 aa  335  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  47.49 
 
 
340 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  46.5 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  45.99 
 
 
342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  45.43 
 
 
350 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  42.32 
 
 
356 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  42.94 
 
 
335 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  44.38 
 
 
343 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  44 
 
 
356 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  43.93 
 
 
353 aa  289  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  46.95 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  43.2 
 
 
342 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  43.45 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  43.45 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  45.31 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  44.27 
 
 
344 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  42.9 
 
 
353 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  42.99 
 
 
352 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  41.59 
 
 
351 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  43.43 
 
 
353 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  44.68 
 
 
342 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  42.58 
 
 
341 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  41.12 
 
 
350 aa  275  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  41.35 
 
 
357 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  41.56 
 
 
359 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  41.12 
 
 
355 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  41.12 
 
 
355 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  43.23 
 
 
341 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  43.63 
 
 
344 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  40.48 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  40.67 
 
 
352 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  43.63 
 
 
354 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  43.83 
 
 
339 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  42.77 
 
 
333 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  42.58 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  43.68 
 
 
281 aa  248  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  42.54 
 
 
365 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  38.26 
 
 
361 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  38.82 
 
 
336 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  38.05 
 
 
366 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  39.14 
 
 
338 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  39.61 
 
 
352 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  37.94 
 
 
336 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  39.87 
 
 
334 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  37.1 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  38.91 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  38.76 
 
 
342 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  46.69 
 
 
256 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  39.81 
 
 
333 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  46.12 
 
 
242 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  34.54 
 
 
344 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  57.85 
 
 
192 aa  155  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  44.35 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  44.35 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  48.82 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  44.35 
 
 
210 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  48.41 
 
 
326 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  42.74 
 
 
332 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  42.98 
 
 
197 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  43.09 
 
 
319 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  43.33 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  44.63 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  42.48 
 
 
329 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  45.83 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  42.98 
 
 
330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  40.32 
 
 
334 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  41.88 
 
 
127 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  44.17 
 
 
291 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  43.8 
 
 
337 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  36.91 
 
 
327 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  45.05 
 
 
333 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  36.92 
 
 
144 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  39.13 
 
 
135 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  37.5 
 
 
198 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  31.58 
 
 
154 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  37.08 
 
 
121 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  40.62 
 
 
81 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  45.21 
 
 
164 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  38.33 
 
 
108 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  27.91 
 
 
90 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  37.04 
 
 
105 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  38.6 
 
 
55 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  31.58 
 
 
88 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>