51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2416 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  99.15 
 
 
472 aa  975    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  979    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  52.54 
 
 
475 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  51.27 
 
 
486 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  51.19 
 
 
474 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  48.93 
 
 
471 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  48.38 
 
 
476 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  46 
 
 
476 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  45.82 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  46.87 
 
 
482 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  46.87 
 
 
478 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  47.08 
 
 
482 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1345  homospermidine synthase  47.73 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0933  Homospermidine synthase  46.75 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  47.85 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  46.65 
 
 
482 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  45.79 
 
 
481 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  46 
 
 
475 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  45.89 
 
 
477 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4552  homospermidine synthase  45.91 
 
 
477 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  45.57 
 
 
476 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4834  homospermidine synthase  45.47 
 
 
478 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109645  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  46 
 
 
470 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  45.45 
 
 
476 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  44.85 
 
 
483 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  45.38 
 
 
481 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  44.83 
 
 
480 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  44.85 
 
 
483 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  45.73 
 
 
483 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  43.64 
 
 
473 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  43.82 
 
 
469 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000430191  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  43.82 
 
 
469 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  43.99 
 
 
481 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  42.58 
 
 
481 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  43.44 
 
 
476 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  41.45 
 
 
472 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  38.51 
 
 
485 aa  346  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0694  homospermidine synthase  37.97 
 
 
486 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  39.46 
 
 
482 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  36.19 
 
 
481 aa  319  7.999999999999999e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  37.16 
 
 
480 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0405  hypothetical protein  24.43 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4913  hypothetical protein  24.43 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0358  hypothetical protein  24.62 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.858837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0343  hypothetical protein  24.62 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0454  hypothetical protein  25.23 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0458  hypothetical protein  25.53 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0338  hypothetical protein  24.32 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0327  hypothetical protein  24.32 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.031116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0390  hypothetical protein  24.32 
 
 
421 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0330  group-specific protein  24.32 
 
 
421 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>