More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2309 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
306 aa  142  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.33 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.91 
 
 
301 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.79 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.33 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.32 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  29.71 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 
289 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.89 
 
 
298 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 
291 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.24 
 
 
309 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  28.32 
 
 
282 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.82 
 
 
320 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 
300 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  27.05 
 
 
303 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 
291 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  27.18 
 
 
297 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  28.76 
 
 
289 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.09 
 
 
295 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
265 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  25.84 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  27.21 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  26.33 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  28.76 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  25.67 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 
282 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  27.43 
 
 
285 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  25.17 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.68 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.97 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.06 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  26.32 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.65 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  26.17 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  22.55 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.3 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  24.91 
 
 
415 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  22.92 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  25.94 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  23.21 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.39 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  23.89 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  24.08 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.81 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  23.59 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.6 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.49 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.67 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  25.83 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.19 
 
 
180 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  22.87 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5983  UspA domain-containing protein  23.98 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.965919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.08 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.33 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  24.65 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  25.77 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.28 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  28.22 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.58 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  23.53 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  23.15 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
162 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  27.18 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  24.52 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.85 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1645  universal stress protein  24.19 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206293  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  23.65 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  26.09 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  24.92 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.84 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  24.24 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  22.8 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  24.58 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  29.73 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  23.67 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  28.28 
 
 
144 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.17 
 
 
150 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  22.48 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.11 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4253  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162019  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.14 
 
 
156 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4249  UspA domain-containing protein  25 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3995  hypothetical protein  23.17 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3786  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4372  UspA domain-containing protein  23.17 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520277  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  23.57 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  24.84 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  23.13 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.28 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.71 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>