166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2298 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  98.58 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  30.61 
 
 		 279 aa  84.7  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01660  conserved hypothetical protein  36.15 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722392  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15952  predicted protein  38.98 
 
 		 123 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49419  predicted protein  35.83 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9486  predicted protein  36.26 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  30.06 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  28.57 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  32.41 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  27.07 
 
 		 459 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  29.32 
 
 		 457 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 385 aa  54.3  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  28.74 
 
 		 461 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0660  RNA methyltransferase, TrmA family  38.96 
 
 		 475 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107668  normal  0.988536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  28.74 
 
 		 461 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  29.25 
 
 		 493 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0965  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.08 
 
 		 473 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1919  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.36 
 
 		 498 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  41.56 
 
 		 487 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32 
 
 		 436 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 457 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  35.42 
 
 		 452 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.26 
 
 		 472 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  35.9 
 
 		 419 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  33 
 
 		 407 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  27.81 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.16 
 
 		 449 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  32.95 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1295  RNA methyltransferase  36.59 
 
 		 476 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.67 
 
 		 449 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5118  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.26 
 
 		 465 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  30.43 
 
 		 398 aa  49.3  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 465 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2360  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 465 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1840  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 485 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 465 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2195  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 485 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 465 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.66 
 
 		 465 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  34.18 
 
 		 392 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.33 
 
 		 449 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.49 
 
 		 443 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6262  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.96 
 
 		 465 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.33 
 
 		 463 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1817  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.96 
 
 		 465 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1841  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.96 
 
 		 465 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.26 
 
 		 472 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1755  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.96 
 
 		 484 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1728  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.96 
 
 		 484 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171324  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.35 
 
 		 469 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.33 
 
 		 463 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  29.63 
 
 		 459 aa  48.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  35.14 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.33 
 
 		 444 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.82 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  32.1 
 
 		 434 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  31.52 
 
 		 392 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2229  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.36 
 
 		 498 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 		 389 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.62 
 
 		 392 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  30.21 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  38.55 
 
 		 493 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  31.31 
 
 		 460 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  32.43 
 
 		 457 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 495 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.67 
 
 		 465 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36 
 
 		 450 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  29.59 
 
 		 448 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 		 442 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  27.87 
 
 		 387 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  37.61 
 
 		 385 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  34.78 
 
 		 288 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.33 
 
 		 445 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  28.78 
 
 		 460 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  28.46 
 
 		 397 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36 
 
 		 450 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  35.06 
 
 		 440 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  32.89 
 
 		 554 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.78 
 
 		 458 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  28.78 
 
 		 458 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1256  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.47 
 
 		 454 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  25.87 
 
 		 407 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36 
 
 		 450 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36 
 
 		 450 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36 
 
 		 450 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.78 
 
 		 458 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.78 
 
 		 458 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  28.78 
 
 		 458 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.78 
 
 		 458 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  31 
 
 		 453 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  31.33 
 
 		 453 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.04 
 
 		 350 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1285  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  35.29 
 
 		 374 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00745486  normal  0.0225207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36 
 
 		 443 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  35 
 
 		 455 aa  45.1  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  33.77 
 
 		 386 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>