214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2102 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  97.52 
 
 
605 aa  1226    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1258    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.53 
 
 
498 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.68 
 
 
498 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  35.14 
 
 
546 aa  250  6e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  33.46 
 
 
572 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  37.62 
 
 
442 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.57 
 
 
514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.3 
 
 
513 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  31.57 
 
 
603 aa  218  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  34 
 
 
473 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  34 
 
 
473 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  34 
 
 
473 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  32.66 
 
 
473 aa  213  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  33.33 
 
 
473 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.43 
 
 
468 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  31.45 
 
 
532 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  34.9 
 
 
485 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  34.64 
 
 
473 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  34.64 
 
 
498 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.56 
 
 
500 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.2 
 
 
411 aa  200  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.73 
 
 
474 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.25 
 
 
478 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  30 
 
 
472 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.33 
 
 
494 aa  164  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.43 
 
 
474 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  32.71 
 
 
483 aa  160  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.97 
 
 
472 aa  160  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.02 
 
 
464 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.15 
 
 
499 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.16 
 
 
425 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1646  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.25 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360042  hitchhiker  0.00112571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.98 
 
 
500 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  31.18 
 
 
395 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  27.17 
 
 
379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  31.89 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  37.14 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  29.06 
 
 
365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.57 
 
 
516 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  27.41 
 
 
365 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  28.42 
 
 
365 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  26.85 
 
 
384 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.74 
 
 
403 aa  97.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  27.69 
 
 
390 aa  94.4  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  27.37 
 
 
384 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.53 
 
 
374 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  24.17 
 
 
457 aa  89  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18041  glutamate decarboxylase  25.93 
 
 
479 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.171895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  25.17 
 
 
384 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  25.52 
 
 
384 aa  87  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.52 
 
 
361 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  24.83 
 
 
384 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  29.3 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1640  glutamate decarboxylase  25.21 
 
 
470 aa  82  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2691  glutamate decarboxylase  25.14 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0236488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  24.71 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3826  glutamate decarboxylase  22.96 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.52 
 
 
365 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  34.97 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8660  glutamate decarboxylase  22.28 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4374  glutamate decarboxylase  23.61 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2341  glutamate decarboxylase  23.68 
 
 
466 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0367356  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0551  glutamate decarboxylase  22.16 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  22.64 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  22.64 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  22.64 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  22.06 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  33.33 
 
 
349 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4739  glutamate decarboxylase  24.55 
 
 
464 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  24.35 
 
 
466 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  22.11 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1616  glutamate decarboxylase  23.36 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  23.06 
 
 
464 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  25.78 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.05 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03063  glutamate decarboxylase  21.72 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  23.35 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  23.12 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1483  glutamate decarboxylase  21.82 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66379  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  23.78 
 
 
464 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4935  glutamate decarboxylase  23.2 
 
 
468 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.79 
 
 
560 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  20.79 
 
 
460 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  21.8 
 
 
468 aa  63.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  22.59 
 
 
515 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40180  Glutamate decarboxylase (GAD) (ERT D1)  26.76 
 
 
569 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0372  glutamate decarboxylase  22.99 
 
 
466 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.84 
 
 
549 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.84 
 
 
549 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03700  glutamate decarboxylase, putative  27.75 
 
 
557 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03700  glutamate decarboxylase, putative  27.75 
 
 
557 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.84 
 
 
549 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0309  glutamate decarboxylase  24.29 
 
 
455 aa  61.6  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0520233  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  23.78 
 
 
521 aa  61.2  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.83 
 
 
549 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.96 
 
 
554 aa  60.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.45 
 
 
551 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.94 
 
 
552 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.25 
 
 
546 aa  59.7  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>