More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1991 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  96.09 
 
 
230 aa  454  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  52.89 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  51.56 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  50.67 
 
 
228 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  51.11 
 
 
228 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  50.22 
 
 
228 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  50.67 
 
 
228 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  48.02 
 
 
237 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  49.56 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  49.56 
 
 
229 aa  218  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  54.63 
 
 
228 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  48.67 
 
 
232 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  54.63 
 
 
228 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  48.03 
 
 
241 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  48.67 
 
 
229 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  48.18 
 
 
239 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  54.63 
 
 
228 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 
232 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 
232 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 
239 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  50.66 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  51.54 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  51.44 
 
 
241 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  48.23 
 
 
236 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  48.03 
 
 
228 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  48.03 
 
 
228 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 
241 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  46.67 
 
 
236 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  47.58 
 
 
235 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  48.91 
 
 
233 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  48.47 
 
 
236 aa  205  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  47.11 
 
 
229 aa  205  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  48.02 
 
 
231 aa  205  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  48.29 
 
 
237 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.81 
 
 
238 aa  204  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  51.16 
 
 
238 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  48.46 
 
 
238 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  46.22 
 
 
228 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  47.6 
 
 
236 aa  202  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  48.46 
 
 
238 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  52.44 
 
 
230 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  47.14 
 
 
233 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  48.21 
 
 
232 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 
237 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  46.7 
 
 
242 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  50.7 
 
 
232 aa  201  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  48.66 
 
 
232 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  49.32 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  51.56 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  44.98 
 
 
237 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  46.29 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 
233 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  47.41 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  44.93 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0421  alanine racemase domain-containing protein  44.83 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0413  alanine racemase domain protein  45.26 
 
 
238 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  45.45 
 
 
234 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  47.58 
 
 
227 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  45.15 
 
 
232 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  46.35 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  47.58 
 
 
229 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  46.46 
 
 
257 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  47.35 
 
 
232 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  46.72 
 
 
231 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0397  hypothetical protein  46.81 
 
 
238 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1687  alanine racemase domain-containing protein  44.07 
 
 
239 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  45.37 
 
 
244 aa  192  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.49 
 
 
234 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  44.49 
 
 
234 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  44.49 
 
 
234 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  44.49 
 
 
234 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  44.49 
 
 
234 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  49.51 
 
 
232 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0294  hypothetical protein  45.89 
 
 
276 aa  191  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  46.7 
 
 
228 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  46.75 
 
 
238 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  45.58 
 
 
242 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1069  alanine racemase domain-containing protein  42.55 
 
 
241 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  50 
 
 
232 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 
232 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  46.26 
 
 
237 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  45.13 
 
 
232 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  46.98 
 
 
238 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  52.22 
 
 
237 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  49.51 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>