More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1976 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  99.67 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  56.72 
 
 		 304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  56.72 
 
 		 304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  50 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  48.5 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  49.34 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  47.84 
 
 		 313 aa  292  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  48.17 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  46.88 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  46.77 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  46.77 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  45.51 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  47.57 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  46.82 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  47.68 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  44.01 
 
 		 315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  50.49 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  48.18 
 
 		 316 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  47.1 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  46.96 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  47.49 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  45.37 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  45.81 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  46.13 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  46.13 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  45.81 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  45.63 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  47.32 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  46.95 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  47 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  47.33 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  44.88 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  46.67 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  43.45 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  43.59 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  46.71 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  48.49 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  49.81 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  44.52 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  44.52 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  44.19 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  44.84 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  45.18 
 
 		 304 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  47.37 
 
 		 303 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  44.87 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  47.04 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  44.23 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  47.04 
 
 		 302 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  44.73 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  45.72 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  49.05 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  45.93 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  46.18 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  41.03 
 
 		 316 aa  254  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  41.03 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  45.4 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  43.73 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  43.33 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  43.33 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  42.58 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  43.09 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  42.28 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  43.14 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  42.58 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  44.92 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  42.26 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  42.26 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  42.26 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  42.26 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  42.48 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1695  preprotein translocase subunit SecF  43.83 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  41.94 
 
 		 316 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  42.07 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  45.97 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  44.13 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  42.44 
 
 		 322 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  41.18 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  41.18 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  41.18 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  43.75 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  41.8 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  40.85 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  41.03 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  47.55 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>