More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1938 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  95.16 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 600 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  35.93 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 198 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  30.9 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 291 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  32.08 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  22.94 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  24 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  29.71 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>