More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1936 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  97.34 
 
 
188 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  55.75 
 
 
176 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  56.36 
 
 
174 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  55.62 
 
 
178 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  56.02 
 
 
175 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  56.02 
 
 
176 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  55.42 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  54.82 
 
 
175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  57.95 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  51.76 
 
 
177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  53.14 
 
 
178 aa  178  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
287 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  56.21 
 
 
173 aa  175  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
172 aa  174  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
172 aa  174  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  52.57 
 
 
176 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  53.29 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  51.52 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  56.89 
 
 
176 aa  171  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  51.53 
 
 
206 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  53.29 
 
 
187 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  51.14 
 
 
179 aa  168  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  51.14 
 
 
179 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  55.21 
 
 
180 aa  168  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.98 
 
 
201 aa  166  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.5 
 
 
378 aa  161  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  54.39 
 
 
177 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  55.69 
 
 
182 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.29 
 
 
189 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  56.63 
 
 
182 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  55.36 
 
 
182 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  54.82 
 
 
175 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  54.82 
 
 
175 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  54.82 
 
 
175 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  51.16 
 
 
181 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.8 
 
 
266 aa  156  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  51.14 
 
 
193 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  53.29 
 
 
176 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  56.29 
 
 
172 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  53.57 
 
 
182 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.37 
 
 
376 aa  154  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
181 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  51.79 
 
 
170 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  51.81 
 
 
176 aa  151  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.55 
 
 
310 aa  150  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  56.89 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  53.01 
 
 
178 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.54 
 
 
357 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  49.69 
 
 
376 aa  147  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.48 
 
 
164 aa  147  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  48.78 
 
 
222 aa  147  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  52.91 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  54.44 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.14 
 
 
195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.16 
 
 
372 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  54.23 
 
 
164 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  54.23 
 
 
164 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.85 
 
 
310 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  54.55 
 
 
310 aa  145  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  51.76 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
168 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  52.12 
 
 
168 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
168 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  46.29 
 
 
172 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  53.52 
 
 
141 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  53.52 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  45.18 
 
 
571 aa  138  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  42.77 
 
 
665 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1769  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.08 
 
 
141 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  51.39 
 
 
141 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  45.68 
 
 
254 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  49.43 
 
 
179 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  53.29 
 
 
177 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  42.94 
 
 
657 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
179 aa  136  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2433  peptidylprolyl isomerase  52.67 
 
 
174 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00223401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  41.54 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  46.25 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.04 
 
 
322 aa  134  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  48.75 
 
 
247 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.03 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  47.67 
 
 
223 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  45.12 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.88 
 
 
218 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  43.43 
 
 
181 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  48.94 
 
 
161 aa  130  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04467  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B Precursor (PPIase B)(Rotamase B)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R3]  48.08 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.497778  normal  0.168508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  43.35 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.44 
 
 
629 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23164  predicted protein  47.44 
 
 
489 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.137553  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  43.79 
 
 
573 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.93 
 
 
195 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.93 
 
 
230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.93 
 
 
230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  50.65 
 
 
372 aa  127  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  43.45 
 
 
178 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  44.58 
 
 
629 aa  127  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0108  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.56 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  44 
 
 
194 aa  127  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>