More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1776 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  96.47 
 
 
1076 aa  2122    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  100 
 
 
1076 aa  2213    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  36.3 
 
 
1118 aa  609  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 
1146 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  36.31 
 
 
1110 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  36.23 
 
 
1110 aa  602  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  33.77 
 
 
1132 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.07 
 
 
1155 aa  555  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.01 
 
 
1129 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  32.6 
 
 
1134 aa  542  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 
1196 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.92 
 
 
1135 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  32.96 
 
 
1182 aa  509  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  33.07 
 
 
1155 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 
1162 aa  286  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.89 
 
 
1197 aa  151  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  25.05 
 
 
1162 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.95 
 
 
1089 aa  142  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  24.47 
 
 
1244 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  23.77 
 
 
1164 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  24.3 
 
 
1106 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.78 
 
 
1119 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  24.27 
 
 
1161 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.56 
 
 
1106 aa  128  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.43 
 
 
1155 aa  127  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  23.41 
 
 
1080 aa  126  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  23.95 
 
 
1187 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  24.6 
 
 
933 aa  125  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 
1185 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.06 
 
 
1203 aa  122  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  23.51 
 
 
1377 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.83 
 
 
1241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  23.41 
 
 
995 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 
1149 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.83 
 
 
1241 aa  115  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.35 
 
 
1240 aa  115  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 
1087 aa  115  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.66 
 
 
1241 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.56 
 
 
1139 aa  114  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.66 
 
 
1241 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 
1110 aa  113  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.66 
 
 
1241 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.48 
 
 
1241 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 
1173 aa  112  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.48 
 
 
1241 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.66 
 
 
1241 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  25.13 
 
 
1125 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  26.85 
 
 
1124 aa  112  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.42 
 
 
1156 aa  112  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.5 
 
 
1061 aa  110  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  23.95 
 
 
1156 aa  109  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.39 
 
 
1241 aa  109  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  26.43 
 
 
1151 aa  109  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 
1120 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  23.58 
 
 
1121 aa  107  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  24.82 
 
 
1242 aa  104  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0306  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.16 
 
 
802 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  25.54 
 
 
1189 aa  103  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03271  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 
802 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  24.62 
 
 
915 aa  102  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.01 
 
 
729 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 
798 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  25.05 
 
 
1182 aa  102  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03281  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 
802 aa  101  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.56 
 
 
758 aa  101  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25.97 
 
 
706 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 
789 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 
1121 aa  100  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.91 
 
 
1230 aa  100  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.95 
 
 
772 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 
816 aa  100  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  24.78 
 
 
1392 aa  99.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 
1173 aa  99.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  26.51 
 
 
1177 aa  99  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  24.87 
 
 
1165 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.92 
 
 
630 aa  98.6  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  27.9 
 
 
797 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.68 
 
 
1157 aa  98.2  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 
762 aa  98.2  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  22.53 
 
 
682 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 
786 aa  97.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  26.58 
 
 
765 aa  96.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 
805 aa  97.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  33.63 
 
 
921 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 
805 aa  97.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  35.32 
 
 
921 aa  96.3  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03371  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 
802 aa  95.9  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  23.66 
 
 
1147 aa  95.9  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 
809 aa  95.5  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  25.77 
 
 
1157 aa  95.9  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 
1041 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 
1110 aa  95.5  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  25.75 
 
 
1124 aa  95.1  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.41 
 
 
755 aa  94.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.24 
 
 
1177 aa  94.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  34.86 
 
 
921 aa  94.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  23.39 
 
 
665 aa  94  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4021  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 
1111 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 
795 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 
1187 aa  93.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>