More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1673 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1673  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
254 aa  524  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1679  30S ribosomal protein S2  99.21 
 
 
254 aa  521  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  62.65 
 
 
248 aa  346  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  61.54 
 
 
247 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17060  30S ribosomal protein S2  64.73 
 
 
246 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1483  30S ribosomal protein S2  64.73 
 
 
246 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1435  30S ribosomal protein S2  65.57 
 
 
247 aa  332  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38990  30S ribosomal protein S2  65.37 
 
 
246 aa  331  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1159  ribosomal protein S2  65.84 
 
 
275 aa  330  9e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0563  SSU ribosomal protein S2P  62.6 
 
 
246 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2548  30S ribosomal protein S2  62.04 
 
 
250 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.443564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1404  30S ribosomal protein S2  65.16 
 
 
247 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3053  30S ribosomal protein S2  63.33 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1534  ribosomal protein S2  65.2 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1343  30S ribosomal protein S2  65.2 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0350  30S ribosomal protein S2  60.32 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.20969  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0389  30S ribosomal protein S2  60.32 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0342077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1591  30S ribosomal protein S2  64.32 
 
 
245 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4082  30S ribosomal protein S2  64.32 
 
 
245 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.610461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4186  30S ribosomal protein S2  64.32 
 
 
245 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1881  30S ribosomal protein S2  64.34 
 
 
247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1342  30S ribosomal protein S2  64.34 
 
 
247 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  0.417524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1101  30S ribosomal protein S2  63.52 
 
 
245 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579602  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1223  30S ribosomal protein S2  60.4 
 
 
250 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.260075  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1278  30S ribosomal protein S2  63.93 
 
 
247 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.160579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1272  ribosomal protein S2  61.73 
 
 
244 aa  322  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120741  normal  0.39597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  59.67 
 
 
243 aa  322  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1146  30S ribosomal protein S2  64.32 
 
 
245 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2585  30S ribosomal protein S2  60 
 
 
250 aa  321  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.062437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0558  30S ribosomal protein S2  66.82 
 
 
284 aa  320  9.000000000000001e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  61 
 
 
248 aa  320  9.000000000000001e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1530  SSU ribosomal protein S2P  64.6 
 
 
249 aa  318  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000131876  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0657  30S ribosomal protein S2  61.86 
 
 
248 aa  318  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  58.85 
 
 
244 aa  318  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1497  ribosomal protein S2  60.17 
 
 
260 aa  317  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  58.61 
 
 
244 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2027  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  315  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2178  30S ribosomal protein S2  58 
 
 
251 aa  315  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00294119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1338  30S ribosomal protein S2  59.44 
 
 
250 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21078  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5329  30S ribosomal protein S2  60.33 
 
 
246 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0468316  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2599  30S ribosomal protein S2  59.44 
 
 
250 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6058  30S ribosomal protein S2  60.33 
 
 
246 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2039  30S ribosomal protein S2  60.33 
 
 
246 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2019  30S ribosomal protein S2  60.33 
 
 
246 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1328  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4948  30S ribosomal protein S2  59.04 
 
 
250 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.532648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1257  ribosomal protein S2  60.17 
 
 
309 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.750455  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1555  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2583  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2437  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1921  30S ribosomal protein S2  59.92 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407888 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2056  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.23127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3255  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2052  30S ribosomal protein S2  59.92 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2493  30S ribosomal protein S2  60.17 
 
 
246 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1682  30S ribosomal protein S2  59.44 
 
 
250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00674019  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0567  30S ribosomal protein S2  58.27 
 
 
256 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2597  30S ribosomal protein S2  59.34 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2695  30S ribosomal protein S2  59.2 
 
 
250 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284652  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1823  30S ribosomal protein S2  58 
 
 
250 aa  309  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1742  30S ribosomal protein S2  59.11 
 
 
248 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0785  SSU ribosomal protein S2P  63.39 
 
 
248 aa  309  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  60.53 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2455  30S ribosomal protein S2  59.44 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.00181584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  60.53 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
241 aa  308  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  58.68 
 
 
242 aa  308  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2850  ribosomal protein S2  59.35 
 
 
248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.274359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2902  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000838626  normal  0.171153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1481  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  307  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000136329  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  61.23 
 
 
269 aa  307  9e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1851  30S ribosomal protein S2  58.92 
 
 
242 aa  307  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1348  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  58.09 
 
 
242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1629  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1438  30S ribosomal protein S2  58 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3161  30S ribosomal protein S2  58.09 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2641  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2708  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000765128  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  58.09 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2815  30S ribosomal protein S2  58.51 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040068  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0256  30S ribosomal protein S2  57.44 
 
 
241 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.424632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0238  30S ribosomal protein S2  57.44 
 
 
241 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0241  30S ribosomal protein S2  57.44 
 
 
241 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1758  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 
250 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0254  30S ribosomal protein S2  57.44 
 
 
241 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0238  30S ribosomal protein S2  57.44 
 
 
241 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.593758 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3435  30S ribosomal protein S2  57.68 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0042148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1066  30S ribosomal protein S2  57.68 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1013  30S ribosomal protein S2  57.68 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000151526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1979  SSU ribosomal protein S2P  58.82 
 
 
240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0314895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3434  ribosomal protein S2  57.02 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0179  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0347621  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0180  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157211  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3491  30S ribosomal protein S2  57.02 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177739  normal  0.659943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00166  hypothetical protein  57.02 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00754113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>