More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1671 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  98.79 
 
 
247 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  68.31 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  68.64 
 
 
245 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  67.5 
 
 
245 aa  331  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  68.22 
 
 
247 aa  330  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  68.64 
 
 
247 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  68.64 
 
 
247 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  68.64 
 
 
247 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  67.93 
 
 
247 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  67.51 
 
 
247 aa  328  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  67.63 
 
 
242 aa  328  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  67.51 
 
 
246 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  67.09 
 
 
247 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  67.09 
 
 
247 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  65.56 
 
 
240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  64.71 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  62.45 
 
 
241 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  62.45 
 
 
241 aa  309  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  60.91 
 
 
245 aa  307  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  62.45 
 
 
241 aa  307  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  62.45 
 
 
241 aa  307  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  61.09 
 
 
245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  62.03 
 
 
241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  60.67 
 
 
245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  59.75 
 
 
245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  61 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  61.51 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  61.6 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  60.67 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  61 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  60.67 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  60.67 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  60.67 
 
 
245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  62.45 
 
 
247 aa  305  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  61.09 
 
 
242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  60.42 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  60.76 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  61.09 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  61.09 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  59.58 
 
 
243 aa  304  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  61.18 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  61.6 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  61.6 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  61.6 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  59.41 
 
 
242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  61.6 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  60.34 
 
 
241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  62.03 
 
 
242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  61.6 
 
 
241 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  61.76 
 
 
249 aa  300  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  60.34 
 
 
241 aa  298  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  60.76 
 
 
247 aa  297  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  56.91 
 
 
245 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  61.97 
 
 
243 aa  293  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  61.04 
 
 
246 aa  293  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  60.78 
 
 
246 aa  293  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  59.34 
 
 
242 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  57.45 
 
 
239 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  62.5 
 
 
243 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.56 
 
 
251 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1849  uridylate kinase  63.71 
 
 
243 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002748  uridylate kinase  62.87 
 
 
241 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000503391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.14 
 
 
251 aa  287  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.14 
 
 
251 aa  287  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2425  uridylate kinase  61.92 
 
 
243 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  58.97 
 
 
242 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  57.26 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.87 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  55.65 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  58.01 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  57.56 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.14 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  58.44 
 
 
236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.98 
 
 
239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  56.71 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  58.01 
 
 
236 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  58.01 
 
 
236 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  56.41 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  59.74 
 
 
239 aa  280  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.67 
 
 
241 aa  280  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  57.14 
 
 
239 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  57.74 
 
 
240 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  56.02 
 
 
258 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.76 
 
 
238 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  58.19 
 
 
238 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  58.01 
 
 
237 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  55.98 
 
 
243 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  59.74 
 
 
236 aa  278  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  56.61 
 
 
240 aa  278  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.32 
 
 
242 aa  278  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  53.39 
 
 
244 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>