244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1608 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1608  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1388  hypothetical protein  95.67 
 
 
254 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0640  deoxyribose-phosphate aldolase  38.25 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3333  deoxyribose-phosphate aldolase  35.17 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0541  deoxyribose-phosphate aldolase  33.6 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0831  deoxyribose-phosphate aldolase  33.46 
 
 
265 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3498  deoxyribose-phosphate aldolase  33.46 
 
 
265 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3627  deoxyribose-phosphate aldolase  33.07 
 
 
265 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2186  deoxyribose-phosphate aldolase  37.5 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.446123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0140  deoxyribose-phosphate aldolase  37.5 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3924  deoxyribose-phosphate aldolase  34.16 
 
 
243 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  0.560793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1140  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
256 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121446  hitchhiker  0.000000000107327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3366  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
256 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0201919  hitchhiker  0.00182556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3230  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
256 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000791533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3147  deoxyribose-phosphate aldolase  34.57 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3227  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.178533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2822  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0142613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1102  deoxyribose-phosphate aldolase  32.64 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0215015  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1217  deoxyribose-phosphate aldolase  32.64 
 
 
256 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1002  deoxyribose-phosphate aldolase  32.92 
 
 
257 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000944927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1041  deoxyribose-phosphate aldolase  32.64 
 
 
256 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000759939  hitchhiker  0.0000000245827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0660  deoxyribose-phosphate aldolase  34.07 
 
 
259 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4821  deoxyribose-phosphate aldolase  33.62 
 
 
271 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4975  deoxyribose-phosphate aldolase  33.62 
 
 
259 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1037  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
256 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000255358  hitchhiker  0.00000000038702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4889  deoxyribose-phosphate aldolase  33.62 
 
 
271 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4982  deoxyribose-phosphate aldolase  33.62 
 
 
259 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4923  deoxyribose-phosphate aldolase  33.62 
 
 
271 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4928  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4930  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04257  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.707451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3617  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04223  hypothetical protein  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5896  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3675  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.635596  normal  0.0472404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3549  deoxyribose-phosphate aldolase  32.64 
 
 
257 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0216784  hitchhiker  0.0000418325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4616  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4980  deoxyribose-phosphate aldolase  34.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2815  deoxyribose-phosphate aldolase  32.24 
 
 
257 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00272907  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1972  deoxyribose-phosphate aldolase  35.02 
 
 
257 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3452  deoxyribose-phosphate aldolase  33.19 
 
 
259 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2862  deoxyribose-phosphate aldolase  35.09 
 
 
257 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0599  deoxyribose-phosphate aldolase  33.04 
 
 
259 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3378  deoxyribose-phosphate aldolase  32.23 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000747392  hitchhiker  0.00551238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1929  deoxyribose-phosphate aldolase  30.71 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1025  deoxyribose-phosphate aldolase  32.24 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0327864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3048  deoxyribose-phosphate aldolase  32.08 
 
 
257 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000145781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0619  deoxyribose-phosphate aldolase  30.34 
 
 
258 aa  118  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2965  deoxyribose-phosphate aldolase  35.06 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4176  deoxyribose-phosphate aldolase  33.47 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3191  deoxyribose-phosphate aldolase  33.47 
 
 
257 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0264  deoxyribose-phosphate aldolase  33.33 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0410  deoxyribose-phosphate aldolase  32.79 
 
 
261 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03377  deoxyribose-phosphate aldolase  29.06 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002629  deoxyribose-phosphate aldolase  29.06 
 
 
258 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0982616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4464  deoxyribose-phosphate aldolase  32 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.45684  normal  0.484684 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0110  deoxyribose-phosphate aldolase  32.79 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0973  deoxyribose-phosphate aldolase  29.79 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.048409  hitchhiker  0.000997229 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1271  deoxyribose-phosphate aldolase  32.79 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0130  deoxyribose-phosphate aldolase  32.79 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1068  deoxyribose-phosphate aldolase  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2811  deoxyribose-phosphate aldolase  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2666  deoxyribose-phosphate aldolase  33.6 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3528  deoxyribose-phosphate aldolase  30.86 
 
 
324 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0831  deoxyribose-phosphate aldolase  34.44 
 
 
257 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0777  Deoxyribose-phosphate aldolase  30.11 
 
 
322 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  31.6 
 
 
329 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.259546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0208  deoxyribose-phosphate aldolase  32.51 
 
 
322 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0828  deoxyribose-phosphate aldolase  31.52 
 
 
336 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0758191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0799  deoxyribose-phosphate aldolase  32.35 
 
 
313 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1996  deoxyribose-phosphate aldolase  33.06 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.734647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0743  deoxyribose-phosphate aldolase  30.83 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4390  deoxyribose-phosphate aldolase  31.54 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.619878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05510  deoxyribose-phosphate aldolase  31.4 
 
 
317 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0363  deoxyribose-phosphate aldolase  30.83 
 
 
313 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3249  deoxyribose-phosphate aldolase  30.92 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3897  deoxyribose-phosphate aldolase  30.89 
 
 
314 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5921  deoxyribose-phosphate aldolase  30.57 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3471  deoxyribose-phosphate aldolase  31.3 
 
 
324 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267268  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3739  deoxyribose phosphate aldolase  31.3 
 
 
324 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0839  deoxyribose-phosphate aldolase  28.69 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000295758  decreased coverage  0.000077294 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3349  ribokinase  31.05 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2837  deoxyribose-phosphate aldolase  31.71 
 
 
319 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  31.4 
 
 
424 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  29.91 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0763  deoxyribose-phosphate aldolase  33.67 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.503498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  32.83 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1349  deoxyribose-phosphate aldolase  30.54 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0850  deoxyribose-phosphate aldolase  31.12 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3271  deoxyribose-phosphate aldolase  28.16 
 
 
328 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2688  deoxyribose-phosphate aldolase  32.93 
 
 
319 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0973  deoxyribose-phosphate aldolase  31.58 
 
 
259 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000205356  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  33.51 
 
 
215 aa  89  6e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  30.69 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  33.67 
 
 
226 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0314  deoxyribose-phosphate aldolase  30.49 
 
 
333 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  30.15 
 
 
219 aa  85.5  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  32.37 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3016  deoxyribose-phosphate aldolase  31.12 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0930267  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  29.78 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>