More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1256 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  98.54 
 
 		 479 aa  955    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  969    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  59.86 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  59.86 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.46 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.08 
 
 		 543 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  39.43 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  43.89 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  38.2 
 
 		 556 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.02 
 
 		 532 aa  359  5e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  41.39 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  36.44 
 
 		 539 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  38.21 
 
 		 524 aa  339  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  39.19 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.84 
 
 		 527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.47 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  39.74 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.31 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.91 
 
 		 517 aa  326  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  38.19 
 
 		 518 aa  323  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  39.66 
 
 		 515 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  39.66 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  38.15 
 
 		 498 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  39.66 
 
 		 519 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  39.66 
 
 		 515 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  43.34 
 
 		 426 aa  319  9e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  39.69 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  39.69 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  39.5 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  38.74 
 
 		 514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 550 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  39.25 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  39.07 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  37 
 
 		 517 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.45 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.55 
 
 		 534 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  37.72 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  39.29 
 
 		 495 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  35.06 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  33.47 
 
 		 534 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 546 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  36.58 
 
 		 476 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  36.3 
 
 		 476 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  36.58 
 
 		 476 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  36.45 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  35.1 
 
 		 473 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.28 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.1 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.61 
 
 		 475 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.95 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.95 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.72 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  34.03 
 
 		 492 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.79 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.54 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  33.82 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 539 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.74 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.74 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.74 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.74 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.74 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.82 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  34.16 
 
 		 570 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.09 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  33.92 
 
 		 557 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  32.52 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  34.07 
 
 		 516 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  34.07 
 
 		 516 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 		 564 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  32.83 
 
 		 578 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  32.42 
 
 		 514 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33 
 
 		 564 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 		 504 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  32.84 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  33.42 
 
 		 511 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  30.33 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  31.02 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  32.66 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.9 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  32.02 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.9 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.9 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.9 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  32.66 
 
 		 528 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  31.65 
 
 		 552 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.65 
 
 		 530 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>