More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1238 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  98.31 
 
 		 590 aa  1179    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1194    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  49.49 
 
 		 593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  41.36 
 
 		 606 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  43.34 
 
 		 594 aa  485  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  40.85 
 
 		 593 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  41.27 
 
 		 614 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  43.33 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  40.58 
 
 		 588 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  39.87 
 
 		 605 aa  452  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  39.93 
 
 		 591 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  40.91 
 
 		 620 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  37.16 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  38.69 
 
 		 641 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  38.23 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  38.55 
 
 		 593 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  39.42 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  37.59 
 
 		 591 aa  412  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  38.14 
 
 		 590 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  38.47 
 
 		 590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  38.05 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  38.23 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  38.62 
 
 		 591 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  38.27 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  38.07 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  35.23 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  36.97 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  36.63 
 
 		 591 aa  369  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  36.9 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  34.63 
 
 		 594 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.05 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 		 584 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.54 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.54 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.05 
 
 		 597 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 		 592 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.08 
 
 		 613 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.21 
 
 		 596 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.21 
 
 		 596 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.44 
 
 		 623 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  28.87 
 
 		 612 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.87 
 
 		 611 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  27.4 
 
 		 622 aa  253  9.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  29.59 
 
 		 580 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  28.65 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.5 
 
 		 610 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.5 
 
 		 630 aa  249  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.56 
 
 		 593 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.34 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.66 
 
 		 627 aa  248  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  28.08 
 
 		 609 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 		 598 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 		 607 aa  243  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.71 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.06 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.71 
 
 		 605 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.99 
 
 		 616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.58 
 
 		 624 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  27.8 
 
 		 610 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.21 
 
 		 619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  28.6 
 
 		 601 aa  232  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.9 
 
 		 602 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.66 
 
 		 608 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  27.4 
 
 		 610 aa  231  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 588 aa  231  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  28.6 
 
 		 588 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  26.3 
 
 		 592 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  26.09 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  27.16 
 
 		 605 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 		 592 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.56 
 
 		 602 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  26.06 
 
 		 620 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  28.42 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.56 
 
 		 602 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  26.44 
 
 		 610 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  25.7 
 
 		 609 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  28.74 
 
 		 581 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  27.97 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  26.72 
 
 		 592 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  26.72 
 
 		 592 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 		 588 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  27.66 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  27.76 
 
 		 613 aa  221  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  27.57 
 
 		 608 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  27.57 
 
 		 608 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  27.47 
 
 		 619 aa  220  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.71 
 
 		 591 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  25.68 
 
 		 611 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  25.77 
 
 		 616 aa  219  8.999999999999998e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  27.81 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  27.57 
 
 		 608 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  27.57 
 
 		 608 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  25.95 
 
 		 592 aa  219  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.66 
 
 		 591 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  27.57 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  26.87 
 
 		 609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  26.6 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  28.75 
 
 		 587 aa  216  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>