More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1208 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  95.9 
 
 
293 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
299 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
299 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
299 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
299 aa  301  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
299 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
299 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
299 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
299 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
324 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  51.36 
 
 
299 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  53.06 
 
 
299 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
332 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
299 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  52.36 
 
 
299 aa  298  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 
299 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 
299 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 
299 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 
299 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 
331 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  52.36 
 
 
299 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  52.03 
 
 
299 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  52.04 
 
 
299 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
298 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 
300 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
298 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
299 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  52.7 
 
 
299 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  50.68 
 
 
298 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
304 aa  291  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  51.34 
 
 
297 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  50.51 
 
 
298 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
299 aa  285  8e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  48.64 
 
 
299 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
299 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 
300 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  50.68 
 
 
299 aa  267  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 
286 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 
295 aa  265  8e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
284 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  46.6 
 
 
294 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
286 aa  251  8.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
287 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
283 aa  245  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
303 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
304 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 
305 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
292 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 
285 aa  218  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  39.86 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
304 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
288 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
282 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
284 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
294 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
288 aa  159  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
289 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
284 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
285 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
285 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
286 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
293 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
296 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  32.12 
 
 
307 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  30.1 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  28.62 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
288 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
284 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.01 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
288 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
287 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
282 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
281 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>