More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1134 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  326  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  326  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  56.49 
 
 
167 aa  200  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.86 
 
 
155 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10843  deaminase  53.39 
 
 
140 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.52974e-17  hitchhiker  0.000000121156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  41.83 
 
 
157 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.38 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  40.85 
 
 
151 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.56 
 
 
157 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  37.86 
 
 
156 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  38.57 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 
160 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.22 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.33 
 
 
150 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.04 
 
 
158 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.6 
 
 
155 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  36.6 
 
 
161 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
160 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.53 
 
 
159 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  35.53 
 
 
159 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 
155 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.06 
 
 
183 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.56 
 
 
157 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
161 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.35 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.1 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.87 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.34 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  35.92 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.24 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.26 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.82 
 
 
153 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  35.82 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.26 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.4 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.25 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.47 
 
 
157 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.3 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.42 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.97 
 
 
153 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.61 
 
 
158 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  33.55 
 
 
149 aa  87  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  35.44 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.82 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  32.47 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.59 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.59 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  33.08 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.65 
 
 
223 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.82 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.02 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  39.47 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.87 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  36.84 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.96 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.45 
 
 
214 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.67 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.05 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.89 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  41.38 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.11 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.71 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  35.11 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.74 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  35.48 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  35.62 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  35.11 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.77 
 
 
301 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  33.65 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.6 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  35.79 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  30.36 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.5 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.11 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  38.3 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.89 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  34.41 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.42 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.85 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  35.79 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.36 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  41.77 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.74 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.17 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  42.11 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.65 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.68 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.34 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.74 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.85 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>