13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1083 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  241  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1113  hypothetical protein  46.02 
 
 
115 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.341492  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0688  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353875  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3361  regulatory protein, MarR  44.32 
 
 
107 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282254  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41590  hypothetical protein  44.32 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52410  hypothetical protein  43.68 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3127  hypothetical protein  39.29 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  decreased coverage  0.00835036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2353  hypothetical protein  31.19 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  30.84 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  27.62 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  25.86 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0270  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  25.42 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>