More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1048 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1048  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  199  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
113 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  46.81 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
130 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  38.71 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.3 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.23 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  34.41 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  31.91 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  30.85 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0451  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  30.85 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.16 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
135 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  30.93 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  31.91 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  30.53 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
115 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  30.85 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  34.44 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  32.95 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
227 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2033  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.0000000453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  30.77 
 
 
227 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  36.23 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>