70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1016 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  96.11 
 
 
659 aa  1290    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  75.86 
 
 
668 aa  1035    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1345    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  40.69 
 
 
708 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  37.89 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  37.14 
 
 
703 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  38.7 
 
 
704 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  38.36 
 
 
719 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  38.68 
 
 
704 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  38.08 
 
 
730 aa  462  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  37.91 
 
 
730 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  37.91 
 
 
730 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  38.21 
 
 
727 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  38.06 
 
 
728 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  37.97 
 
 
701 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  38.06 
 
 
729 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  37.25 
 
 
730 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  38.51 
 
 
733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  38 
 
 
707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  37.61 
 
 
719 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  36.81 
 
 
719 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  38.05 
 
 
718 aa  452  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  37.7 
 
 
708 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  37.56 
 
 
718 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  36.99 
 
 
721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  37.78 
 
 
719 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  37.3 
 
 
744 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  37.74 
 
 
718 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  37.95 
 
 
743 aa  442  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  37.3 
 
 
743 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  38.37 
 
 
664 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  35.04 
 
 
752 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  29.6 
 
 
637 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  29.23 
 
 
615 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  27.42 
 
 
621 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  28.22 
 
 
633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  27.84 
 
 
635 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  26.74 
 
 
629 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  29.79 
 
 
635 aa  206  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  27.93 
 
 
635 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  44.65 
 
 
293 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  26.23 
 
 
635 aa  187  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  28.1 
 
 
622 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  27.89 
 
 
618 aa  177  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  27.89 
 
 
618 aa  177  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  24.63 
 
 
650 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  25.07 
 
 
629 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  26.37 
 
 
622 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  25.27 
 
 
622 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  47.1 
 
 
290 aa  150  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  22.18 
 
 
624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  27.79 
 
 
464 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  24.7 
 
 
470 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.94 
 
 
455 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  22.2 
 
 
589 aa  90.5  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  38.89 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  38.89 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  22.56 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.79 
 
 
557 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  22.45 
 
 
612 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  20.25 
 
 
786 aa  58.9  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5394  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.94 
 
 
579 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.709491  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4965  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.94 
 
 
579 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  30.39 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  22.04 
 
 
934 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1477  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  35.62 
 
 
609 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  34.25 
 
 
635 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  37.36 
 
 
661 aa  44.3  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.95 
 
 
765 aa  43.9  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  26.14 
 
 
876 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>