More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0954 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  100 
 
 
312 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  99.04 
 
 
312 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.87 
 
 
309 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.81 
 
 
312 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.93 
 
 
309 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  60.84 
 
 
311 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.23 
 
 
311 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
309 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.58 
 
 
308 aa  358  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.42 
 
 
314 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.33 
 
 
309 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.36 
 
 
309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.23 
 
 
317 aa  355  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.23 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.36 
 
 
309 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.9 
 
 
308 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.61 
 
 
313 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.93 
 
 
308 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.36 
 
 
309 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.96 
 
 
309 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.36 
 
 
308 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  58.36 
 
 
309 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.35 
 
 
313 aa  350  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  55.81 
 
 
314 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  57.1 
 
 
311 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.28 
 
 
308 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  59.02 
 
 
309 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.77 
 
 
311 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.28 
 
 
308 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.77 
 
 
311 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  57.1 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.45 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.45 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1217  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  55.48 
 
 
314 aa  346  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.28 
 
 
307 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.77 
 
 
311 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  60 
 
 
309 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.28 
 
 
308 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
311 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.96 
 
 
308 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.02 
 
 
309 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.34 
 
 
309 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1262  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.48 
 
 
314 aa  345  6e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.19 
 
 
310 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.99 
 
 
307 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.13 
 
 
311 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.63 
 
 
310 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.05 
 
 
315 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.93 
 
 
307 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.33 
 
 
321 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  56.77 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.77 
 
 
307 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.58 
 
 
308 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.58 
 
 
308 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.58 
 
 
308 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.9 
 
 
308 aa  341  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.61 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.47 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.84 
 
 
313 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.37 
 
 
307 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.9 
 
 
307 aa  338  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  54.75 
 
 
321 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.77 
 
 
311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.48 
 
 
311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  55.73 
 
 
327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.84 
 
 
310 aa  334  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.52 
 
 
310 aa  334  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  59.34 
 
 
309 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.92 
 
 
309 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.93 
 
 
309 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.4 
 
 
307 aa  332  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  55.48 
 
 
309 aa  332  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.15 
 
 
317 aa  331  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  54.78 
 
 
314 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7938  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.91 
 
 
315 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256052  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.58 
 
 
310 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.27 
 
 
316 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.39 
 
 
311 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.81 
 
 
308 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.31 
 
 
309 aa  329  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.42 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  55.81 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.45 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.16 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.31 
 
 
314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  55.48 
 
 
309 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.87 
 
 
310 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.4 
 
 
314 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.38 
 
 
310 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.87 
 
 
311 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.15 
 
 
317 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.24 
 
 
319 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>