More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0857 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  96.39 
 
 
443 aa  850    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
443 aa  905    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.92 
 
 
457 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.37 
 
 
449 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.85 
 
 
451 aa  360  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.15 
 
 
449 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.15 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.15 
 
 
449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.15 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  47.05 
 
 
447 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.25 
 
 
455 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.18 
 
 
461 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.12 
 
 
414 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.7 
 
 
458 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.01 
 
 
446 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.41 
 
 
467 aa  349  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  45.66 
 
 
452 aa  349  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  41.99 
 
 
450 aa  349  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.86 
 
 
458 aa  348  8e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.93 
 
 
456 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.05 
 
 
465 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.93 
 
 
456 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.93 
 
 
456 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.44 
 
 
414 aa  348  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  41.93 
 
 
456 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.15 
 
 
456 aa  346  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.15 
 
 
456 aa  346  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.12 
 
 
448 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.89 
 
 
448 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.89 
 
 
448 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.45 
 
 
443 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.89 
 
 
448 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.36 
 
 
454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.57 
 
 
462 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.08 
 
 
448 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.02 
 
 
448 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.82 
 
 
458 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.35 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.63 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.93 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.22 
 
 
466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.34 
 
 
464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.93 
 
 
456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.45 
 
 
444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.15 
 
 
463 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.92 
 
 
463 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2951  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.55 
 
 
447 aa  329  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19698  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.53 
 
 
445 aa  328  9e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.18 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.86 
 
 
445 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.04 
 
 
452 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.77 
 
 
445 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.43 
 
 
463 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.42 
 
 
442 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.59 
 
 
452 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.59 
 
 
452 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.95 
 
 
450 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.54 
 
 
442 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.28 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.82 
 
 
476 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.12 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.64 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.06 
 
 
458 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.11 
 
 
459 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.85 
 
 
448 aa  319  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.65 
 
 
447 aa  319  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.46 
 
 
448 aa  318  9e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.4 
 
 
447 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.36 
 
 
452 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.59 
 
 
446 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.14 
 
 
451 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.61 
 
 
465 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.81 
 
 
458 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.15 
 
 
446 aa  317  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.66 
 
 
459 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.64 
 
 
442 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.81 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.58 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000134785  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.43 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.75 
 
 
453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.39 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.2 
 
 
448 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.88 
 
 
398 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.49 
 
 
459 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.49 
 
 
462 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.91 
 
 
457 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.18 
 
 
447 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.05 
 
 
469 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0539  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.58 
 
 
459 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3121  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.63 
 
 
444 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2527  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.91 
 
 
440 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.258922  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.59 
 
 
450 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173866  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.86 
 
 
459 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0516461  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.41 
 
 
460 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>