237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0539 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  99.22 
 
 
514 aa  1070    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  100 
 
 
514 aa  1079    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  54.15 
 
 
515 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  53.59 
 
 
511 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
519 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  54.55 
 
 
515 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  53.39 
 
 
511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 
511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  53.39 
 
 
511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  52.69 
 
 
509 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  53.16 
 
 
519 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  52.51 
 
 
520 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
511 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  53.48 
 
 
511 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 
517 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  52.99 
 
 
508 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 
514 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  53.71 
 
 
510 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
510 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  53.75 
 
 
514 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 
515 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  53.75 
 
 
514 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  52.35 
 
 
515 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
514 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  52.31 
 
 
525 aa  551  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  53.32 
 
 
510 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  52.35 
 
 
515 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  53.56 
 
 
514 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 
513 aa  549  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  52.86 
 
 
514 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  52.57 
 
 
514 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  53.75 
 
 
514 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  53.16 
 
 
514 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  52.19 
 
 
529 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  52.86 
 
 
514 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
514 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
514 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  51.98 
 
 
514 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  53.16 
 
 
514 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.67 
 
 
510 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 
516 aa  542  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  52.86 
 
 
514 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  52.66 
 
 
514 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
514 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  52.79 
 
 
509 aa  544  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  52.66 
 
 
519 aa  545  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  52.17 
 
 
517 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
516 aa  535  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  51.38 
 
 
513 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  50.5 
 
 
511 aa  531  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  53.53 
 
 
510 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 
517 aa  529  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 
509 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 
509 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
513 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
509 aa  518  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 
525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  51.29 
 
 
523 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
512 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  51.83 
 
 
530 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
513 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 
552 aa  510  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 
512 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 
510 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
512 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.5 
 
 
514 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
518 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 
512 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
512 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
516 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 
512 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 
521 aa  498  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  49.11 
 
 
510 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
511 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
552 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  47.2 
 
 
516 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
513 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  47.47 
 
 
533 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 
512 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 
504 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 
516 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 
516 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  47.66 
 
 
513 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>