59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0231 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  501  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  96.68 
 
 
241 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  30.48 
 
 
201 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.56 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  24.34 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  22.16 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  21.74 
 
 
200 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  30.4 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  28.47 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  26.43 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  23.78 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  22.92 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  22.92 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  22.92 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  22.92 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  22.92 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  21.62 
 
 
196 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  24.04 
 
 
188 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  25 
 
 
187 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  24.5 
 
 
187 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  24.5 
 
 
187 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  24.5 
 
 
187 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  24.5 
 
 
187 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  24.5 
 
 
187 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  24.49 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  24.49 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  24.5 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  23.02 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  22.86 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  25.17 
 
 
182 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  25.17 
 
 
182 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  20.21 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  20.21 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  23.94 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  21.83 
 
 
188 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  20.74 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.81 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  21.62 
 
 
188 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  24 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3329  hypothetical protein  22.98 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.488614  normal  0.577133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.83 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  20.67 
 
 
188 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.69 
 
 
191 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  30.21 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  21.3 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  21.72 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  23.33 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  23.33 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  22.78 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  21.72 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  21.74 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  21.93 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  21.74 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  25.51 
 
 
192 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  19.79 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>