20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0158 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  497  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  95.8 
 
 
238 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  26.96 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  26.89 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  26.55 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  25.64 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  31.51 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  24.89 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  24.56 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  23.18 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  25 
 
 
251 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  24.78 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  24.46 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  26.17 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  23.85 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  37.31 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  23.39 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  20.91 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  23.68 
 
 
223 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  20.44 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>