80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0060 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0060  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0061  hypothetical protein  96.76 
 
 
247 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2436  glutaredoxin  75.31 
 
 
291 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2539  glutaredoxin  67.35 
 
 
249 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0106  glutaredoxin  68.29 
 
 
249 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6238  glutaredoxin  65.57 
 
 
248 aa  359  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.468297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3739  glutaredoxin  66.94 
 
 
248 aa  352  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1624  hypothetical protein  69.29 
 
 
245 aa  344  7e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.707907  normal  0.49317 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5419  glutaredoxin  64.61 
 
 
251 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.137324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3244  hypothetical protein  67.89 
 
 
255 aa  338  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1124  glutaredoxin  66.4 
 
 
247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818826 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3791  glutaredoxin  64.08 
 
 
254 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0378197  normal  0.280693 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3931  glutaredoxin  64.08 
 
 
254 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  61.89 
 
 
265 aa  321  8e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1943  hypothetical protein  59.66 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00406  hypothetical protein  56.47 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00187  glutaredoxin  55.6 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  44.49 
 
 
278 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  42.68 
 
 
261 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  42.28 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12821  hypothetical protein  39.49 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12751  hypothetical protein  39.24 
 
 
150 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0333915  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1204  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000421468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1278  hypothetical protein  34.3 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1892  hypothetical protein  36.07 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  43.1 
 
 
112 aa  52.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  35.82 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
87 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  39.34 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  40 
 
 
85 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 
85 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  38.1 
 
 
247 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
86 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
81 aa  46.6  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.67 
 
 
85 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  43.86 
 
 
85 aa  46.2  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
86 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  41.38 
 
 
85 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
86 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 
86 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 
81 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  34.33 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
81 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
85 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  39.68 
 
 
86 aa  45.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  35.14 
 
 
95 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  34.72 
 
 
85 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  34.92 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  37.7 
 
 
84 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  36.07 
 
 
83 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  36.07 
 
 
83 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  38.75 
 
 
89 aa  44.3  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1813  hypothetical protein  48.72 
 
 
40 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00526028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
86 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  34.43 
 
 
86 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  36.07 
 
 
87 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  36.51 
 
 
85 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  33.87 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  36.51 
 
 
85 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  32.79 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  33.87 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  36.07 
 
 
87 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  30.99 
 
 
87 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  28.79 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  32.76 
 
 
84 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  33.77 
 
 
101 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.66 
 
 
459 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  32.76 
 
 
84 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 
89 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  35 
 
 
89 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  33.33 
 
 
243 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  33.33 
 
 
243 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 
243 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>