More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0055 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0055  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  631  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0057  hypothetical protein  97.68 
 
 		 302 aa  618  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0178  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06260  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308123  normal  0.145947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  26.97 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1776  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2973  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  23.59 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3798  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  26.87 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  24.51 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.67 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3141  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.32 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  28.32 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3593  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.480915  normal  0.520178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02974  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0596  transcriptional regulator, LysR family  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02925  hypothetical protein  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0591  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3403  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3580  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4420  transcriptional regulator, LysR family  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0786567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  24.61 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3295  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3423  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3426  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0409161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3530  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  22.88 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3496  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2849  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.794351  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  28.06 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  25.35 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  27.7 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.4 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  27.96 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  25.4 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  25.4 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0601  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  24.9 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  26.15 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>