158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0005 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  97.69 
 
 
346 aa  713    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  43.84 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  47.08 
 
 
346 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  42.62 
 
 
372 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  40.98 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  41.26 
 
 
368 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  40.71 
 
 
368 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  42.46 
 
 
367 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  40.44 
 
 
368 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  40.06 
 
 
364 aa  299  5e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  42.46 
 
 
367 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  40.44 
 
 
368 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  42.31 
 
 
368 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  39.89 
 
 
368 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  41.71 
 
 
368 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  40.44 
 
 
369 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  41.39 
 
 
371 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  41.39 
 
 
371 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  41.39 
 
 
365 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  42.46 
 
 
370 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  41.26 
 
 
368 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  42.86 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  41.05 
 
 
365 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  40.12 
 
 
347 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  41.05 
 
 
365 aa  279  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  40.52 
 
 
348 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  41.06 
 
 
348 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  39.89 
 
 
370 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  40.38 
 
 
374 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  39.89 
 
 
370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  42.9 
 
 
350 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  40.11 
 
 
369 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  39.89 
 
 
370 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  39.44 
 
 
370 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  39.34 
 
 
370 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  39.44 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  39.61 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  39.06 
 
 
370 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  39.06 
 
 
370 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  38.78 
 
 
370 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  39.89 
 
 
355 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  39.94 
 
 
340 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  38.67 
 
 
375 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  37.57 
 
 
371 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  39.94 
 
 
624 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  41.89 
 
 
346 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  39.1 
 
 
331 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  36.01 
 
 
365 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  36.83 
 
 
334 aa  256  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  35.73 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  37.29 
 
 
373 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  35.91 
 
 
366 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  37.68 
 
 
347 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  36.66 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  36.63 
 
 
640 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  38.97 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  37.31 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  37.43 
 
 
358 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  36.29 
 
 
352 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  36.89 
 
 
349 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  35.42 
 
 
371 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  41.74 
 
 
346 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  39.88 
 
 
639 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  36.74 
 
 
369 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  37.68 
 
 
348 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  37.07 
 
 
353 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  36.47 
 
 
375 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  37.21 
 
 
349 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  38.24 
 
 
386 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  37.31 
 
 
374 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  38.39 
 
 
339 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.78 
 
 
348 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.67 
 
 
350 aa  235  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  36.34 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  36.26 
 
 
631 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  36.69 
 
 
345 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  36.15 
 
 
348 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.94 
 
 
349 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  33.91 
 
 
352 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  35.17 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  37.09 
 
 
336 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  31.58 
 
 
373 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.38 
 
 
343 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  35.31 
 
 
372 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  36.61 
 
 
364 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.91 
 
 
349 aa  215  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  35.12 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  34.73 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  35 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  38.92 
 
 
370 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.1 
 
 
351 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  35.17 
 
 
377 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  35.63 
 
 
383 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  33.04 
 
 
368 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  33.04 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.2 
 
 
332 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  34.42 
 
 
351 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  34.53 
 
 
336 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>