25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0079 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  971    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  30.81 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  33.42 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  35.42 
 
 		 466 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  34.15 
 
 		 466 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  33.51 
 
 		 243 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  31.69 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  43.61 
 
 		 199 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2491  hypothetical protein  35.54 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  47.62 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0797  PAAR domain-containing protein  50 
 
 		 352 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  47.62 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  47.62 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  32.53 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2991  PAAR domain-containing protein  50 
 
 		 352 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2589  hypothetical protein  50 
 
 		 352 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  31.38 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  29.76 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  29.51 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  34.45 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  24.32 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  37.61 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  40.98 
 
 		 133 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  34.21 
 
 		 176 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>