17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0051 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  373  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5199  hypothetical protein  35 
 
 
90 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296541  normal  0.38964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  26.59 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  27.75 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  28.25 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  27.22 
 
 
175 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  26.83 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  29.87 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  27.33 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1929  hypothetical protein  31.33 
 
 
120 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  26.67 
 
 
137 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  46 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  27.07 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  39.62 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  37.74 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  37.66 
 
 
89 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  30.77 
 
 
141 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>