298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4238 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4621  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0773433  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4636  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  6.17917e-10  normal  0.102645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4635  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.55616e-10  normal  0.101529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4634  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.34065e-09  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1272  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.31558e-11  hitchhiker  0.00050925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0099  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.02602e-09  hitchhiker  1.12339e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0098  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.12871e-09  hitchhiker  1.1037e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.46877e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0072  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.37146e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  5.44411e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  5.55538e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  5.07488e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0100  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.50184e-09  hitchhiker  1.1037e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0075  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000219757  hitchhiker  4.3748e-10 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0905677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831338  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578949  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2100  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.0713e-08  hitchhiker  0.00742467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4772  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0349282  normal  0.0463212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4771  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0774418  normal  0.0477012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4770  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081993  normal  0.0474475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2159  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.0146e-05  hitchhiker  3.99675e-10 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4715  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  4.47473e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4714  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  4.34164e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4713  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  6.28105e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2107  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  5.15122e-06  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4954  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.53884e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4953  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.53884e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0992  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.34498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.03528e-07  unclonable  1.89015e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0013  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  9.58382e-08  unclonable  1.89015e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2337  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2338  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00378756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2616  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.256373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.31988e-10  hitchhiker  5.12691e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4238  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.11599e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4278  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.82195e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4279  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.42412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4280  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30122e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5111  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.5095e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5110  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.38162e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5109  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.69748e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5039  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.0276e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4725  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.64891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4671  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.05705e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.31988e-10  hitchhiker  5.37949e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.96404e-10  hitchhiker  4.93359e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.60398e-09  unclonable  1.83303e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  2.28053e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432235  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.623556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.0236363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2055  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.08601e-12  hitchhiker  0.000600208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0352694  hitchhiker  0.000658137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0077  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707613  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0078  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67777  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0080  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.8513  normal  0.517696 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0707  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0600854  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0706  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583224  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4724  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.56815e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00145932  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4723  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.032e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00031  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.57185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA59  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0609929  normal  0.691703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0082  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0051  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00647141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0807004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0019  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000726864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R50  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R61  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R63  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R65  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0013  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.854164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA57  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256598  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA45  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000360899  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0083  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00080  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.19569e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00081  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.57411e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00082  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.39785e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.35893e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0083  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.37865e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0084  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.41323e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0085  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.68672e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0080  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t21  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t23  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t38  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0079  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.871373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0081  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2683  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.2071e-09  normal  0.045375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>