84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4166 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  99.52 
 
 
223 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  30.15 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  34.92 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.15 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  34.51 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  30.87 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  36.05 
 
 
140 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  33.68 
 
 
154 aa  62  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  31.96 
 
 
106 aa  62  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  36.05 
 
 
137 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  36.05 
 
 
136 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  34.15 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  33.63 
 
 
138 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  35.19 
 
 
125 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  35.4 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  25.71 
 
 
147 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  34.91 
 
 
128 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  30.58 
 
 
158 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  33.68 
 
 
148 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  34.74 
 
 
149 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  34.74 
 
 
149 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  34.74 
 
 
149 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  33.68 
 
 
148 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  32.63 
 
 
147 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  30.97 
 
 
137 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  31.45 
 
 
159 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  30.25 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  29.47 
 
 
102 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  25.37 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  27.2 
 
 
164 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  52.4  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  32.69 
 
 
282 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  33.68 
 
 
149 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  30.39 
 
 
138 aa  51.6  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  30.72 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  29.51 
 
 
131 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  35.51 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  27.5 
 
 
130 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  28.69 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  31.43 
 
 
148 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  26.21 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  39.71 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  33.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  31 
 
 
132 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  31 
 
 
132 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  29.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  27.37 
 
 
122 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  28.81 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  30.39 
 
 
278 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  24.83 
 
 
172 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
123 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  27.45 
 
 
171 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  27.97 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  30.58 
 
 
131 aa  45.1  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  31.25 
 
 
262 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  31.25 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  29.81 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  28.09 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  24.84 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  24.84 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.7 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  26.13 
 
 
119 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  29.81 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  29.7 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  26.12 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  31.25 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  25.95 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  32.29 
 
 
138 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  31.25 
 
 
173 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  26.02 
 
 
150 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  32.58 
 
 
148 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>