200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3996 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 		 278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 		 278 aa  560  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 		 259 aa  523  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  73.38 
 
 		 278 aa  427  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  68.25 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  66.91 
 
 		 277 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  61.09 
 
 		 274 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  56.36 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  56.36 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  56.36 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  57.46 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  57.46 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  56 
 
 		 276 aa  318  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  54.18 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  60.58 
 
 		 280 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  53.82 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  53.82 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  53.82 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  53.82 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  53.82 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  53.82 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  53.82 
 
 		 276 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  53.82 
 
 		 276 aa  315  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  45.68 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  43.75 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  43.01 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  45.99 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  39.93 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  42.96 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  39.72 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  39.36 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  39.58 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  38.79 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  39.57 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  40.74 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  40.07 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  39.57 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  39.35 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  38.77 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  38.57 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  40 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  38.89 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  38.04 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  38.15 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  33.78 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  34.86 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  38.49 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  36.05 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  28.42 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  30.63 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  36.22 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  29.82 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  41.18 
 
 		 224 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  42.14 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  39.6 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  42.77 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  41.51 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  33.08 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  32.54 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  40.88 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  32.38 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  43.07 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  33.52 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  27.27 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  35.66 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  30.27 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  27.14 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  26.23 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  26.63 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  24.52 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  32.85 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.13 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  32.32 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.11 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  30.37 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  32.37 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  32.14 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  24.53 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  25 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  26.02 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  24.53 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  28.32 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  28.16 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  25.16 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  26.11 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  26.6 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  25.88 
 
 		 396 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  29.23 
 
 		 389 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  26.32 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  24.68 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 519 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  24.71 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  29.85 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  29.23 
 
 		 386 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  25.54 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  29.32 
 
 		 235 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>