277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3917 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  100 
 
 
157 aa  311  3e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  99.36 
 
 
157 aa  309  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  8.8272e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  99.36 
 
 
157 aa  309  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.2678e-08  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  90.26 
 
 
154 aa  279  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.56598e-09  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  83.44 
 
 
157 aa  267  3e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.94791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  85.06 
 
 
157 aa  265  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.92786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  84.42 
 
 
157 aa  264  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  9.58722e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  82.17 
 
 
157 aa  263  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  258  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.51837e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  258  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.70757e-06  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  257  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.18391e-08  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.03122e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  83.12 
 
 
158 aa  257  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  82.47 
 
 
158 aa  256  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.78059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  79.62 
 
 
158 aa  256  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  79.62 
 
 
158 aa  256  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  79.62 
 
 
158 aa  256  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  79.62 
 
 
158 aa  256  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  81.17 
 
 
158 aa  255  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.03418e-05  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  79.62 
 
 
158 aa  256  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  72.61 
 
 
158 aa  231  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  7.06514e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  71.24 
 
 
158 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  71.24 
 
 
172 aa  222  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  67.52 
 
 
158 aa  220  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  67.52 
 
 
158 aa  220  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  68.18 
 
 
156 aa  219  1e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  67.31 
 
 
157 aa  217  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  66.88 
 
 
156 aa  213  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  65.61 
 
 
159 aa  212  2e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  63.06 
 
 
158 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  63.23 
 
 
158 aa  208  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  64.94 
 
 
154 aa  207  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  63.69 
 
 
157 aa  206  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  63.06 
 
 
157 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  62.34 
 
 
159 aa  200  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  60.9 
 
 
158 aa  199  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  62.34 
 
 
159 aa  198  2e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  62.34 
 
 
159 aa  198  2e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  62.99 
 
 
159 aa  199  2e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  62.34 
 
 
159 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  63.64 
 
 
159 aa  197  4e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  59.62 
 
 
158 aa  196  8e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  4.27198e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  62.34 
 
 
156 aa  196  1e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  64.29 
 
 
154 aa  195  2e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  62.34 
 
 
156 aa  194  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  61.69 
 
 
159 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  61.44 
 
 
159 aa  192  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  57.05 
 
 
158 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  59.62 
 
 
158 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  63.23 
 
 
157 aa  190  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  58.97 
 
 
160 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  62.5 
 
 
159 aa  188  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  57.69 
 
 
159 aa  188  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  58.06 
 
 
180 aa  188  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  58.71 
 
 
224 aa  187  3e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  59.21 
 
 
154 aa  187  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  56.77 
 
 
158 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  56.77 
 
 
158 aa  186  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  56.77 
 
 
158 aa  186  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  58.71 
 
 
156 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  58.71 
 
 
156 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  58.06 
 
 
158 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  56.77 
 
 
159 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  57.05 
 
 
158 aa  183  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  57.42 
 
 
159 aa  183  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  59.73 
 
 
154 aa  182  1e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  59.73 
 
 
154 aa  182  2e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  57.42 
 
 
158 aa  178  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  58.97 
 
 
159 aa  178  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  57.24 
 
 
158 aa  177  6e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  177  6e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  52.56 
 
 
158 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  55.19 
 
 
168 aa  174  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  55.26 
 
 
159 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  57.52 
 
 
160 aa  173  1e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  54.19 
 
 
158 aa  172  2e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2530  bacterioferritin subunit 2  60.39 
 
 
156 aa  171  4e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  0.794719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  58.9 
 
 
162 aa  171  4e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  57.79 
 
 
157 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  53.25 
 
 
154 aa  171  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  52.56 
 
 
159 aa  169  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>