More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3867 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2114  elongation factor Tu  77.97 
 
 
396 aa  636  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  3.14964e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  728  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  2.76048e-05  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0374  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  727  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00309992  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0332  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  800  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000132948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0278  elongation factor Tu  94.66 
 
 
394 aa  733  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.12884e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0482  elongation factor Tu  79.09 
 
 
397 aa  637  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448228  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0470  elongation factor Tu  79.09 
 
 
397 aa  637  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00495731  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3674  elongation factor Tu  94.66 
 
 
394 aa  733  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.19951e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2803  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  800  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.8967e-08  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  79.85 
 
 
397 aa  664  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.34885e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  79.85 
 
 
397 aa  664  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.67982e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  81.31 
 
 
396 aa  673  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.51927e-06  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  81.31 
 
 
396 aa  672  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  4.5907e-07  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0503  elongation factor Tu  82.53 
 
 
396 aa  644  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0389  elongation factor Tu  82.28 
 
 
396 aa  643  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100632  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3620  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  727  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.72822e-05  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4428  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  728  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.75004e-09  hitchhiker  9.74336e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4751  elongation factor Tu  79.09 
 
 
397 aa  637  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000118941  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2101  elongation factor Tu  77.97 
 
 
396 aa  636  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.235673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  82.83 
 
 
396 aa  681  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  82.83 
 
 
396 aa  681  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  80.25 
 
 
396 aa  662  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  2.6192e-12  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  80.51 
 
 
396 aa  667  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.75684e-07  hitchhiker  1.48389e-10 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  81.27 
 
 
396 aa  668  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  81.27 
 
 
396 aa  668  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2203  elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  638  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  8.05833e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2191  elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  638  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  82.58 
 
 
396 aa  678  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  82.58 
 
 
396 aa  678  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.14669e-07  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  88.04 
 
 
394 aa  692  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.92421e-07  hitchhiker  3.9393e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  88.3 
 
 
394 aa  694  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.01844e-07  unclonable  3.72179e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4763  elongation factor Tu  79.09 
 
 
397 aa  637  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  5.00279e-06  normal  0.983008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0198  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  679  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.78702e-07  unclonable  1.27922e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0186  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  679  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.52251e-05  hitchhiker  0.000684703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0194  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  679  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.23717e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0182  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  679  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.14209e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  84.38 
 
 
397 aa  689  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  84.38 
 
 
400 aa  689  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  78.13 
 
 
407 aa  655  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.89642e-06  unclonable  6.40465e-12 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2043  elongation factor Tu  83.5 
 
 
396 aa  643  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.75899e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1860  elongation factor Tu  83.5 
 
 
396 aa  644  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.59791e-08  hitchhiker  0.00222583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0485  elongation factor Tu  79.09 
 
 
397 aa  637  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  9.94987e-05  normal  0.0792856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0473  elongation factor Tu  79.09 
 
 
397 aa  637  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00354481  normal  0.0345363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2774  elongation factor Tu  88.55 
 
 
394 aa  694  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.37207e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2723  elongation factor Tu  88.55 
 
 
394 aa  694  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.08037e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  81.61 
 
 
397 aa  669  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  81.61 
 
 
397 aa  669  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  88.04 
 
 
394 aa  692  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.80335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3867  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  800  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.62451e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3918  elongation factor Tu  94.66 
 
 
394 aa  733  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.13111e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  641  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0182  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  684  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.66988e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  684  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  94.15 
 
 
394 aa  729  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.12961e-08  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  94.15 
 
 
394 aa  727  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.76369e-08  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  87.28 
 
 
394 aa  686  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.3337e-07  unclonable  1.08013e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4519  elongation factor Tu  93.38 
 
 
394 aa  726  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.4313e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3808  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  727  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.7346e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4213  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  728  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.91099e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3535  elongation factor Tu  93.64 
 
 
394 aa  727  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00233  elongation factor Tu  86.8 
 
 
394 aa  667  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00054  elongation factor Tu  86.8 
 
 
394 aa  667  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  79.85 
 
 
397 aa  664  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.16391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  79.85 
 
 
397 aa  664  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  641  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  88.04 
 
 
394 aa  692  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.88214e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  82.07 
 
 
396 aa  675  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  83.59 
 
 
396 aa  679  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  82.32 
 
 
396 aa  676  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  80.2 
 
 
402 aa  667  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  1.07296e-06 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4917  elongation factor Tu  79.8 
 
 
397 aa  654  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0581  elongation factor Tu  79.8 
 
 
397 aa  654  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  84.38 
 
 
397 aa  692  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  84.38 
 
 
397 aa  692  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3253  elongation factor Tu  82.78 
 
 
396 aa  643  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0271  elongation factor Tu  82.78 
 
 
396 aa  643  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  4.02201e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  82.37 
 
 
396 aa  670  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  82.37 
 
 
396 aa  670  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  1.51481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  643  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  643  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  80.81 
 
 
396 aa  649  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  80.81 
 
 
396 aa  649  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0401  elongation factor Tu  96.69 
 
 
394 aa  747  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  2.73455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3738  elongation factor Tu  96.69 
 
 
394 aa  747  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00744191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03141  hypothetical protein  93.64 
 
 
394 aa  727  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002300  translation elongation factor Tu  86.8 
 
 
394 aa  668  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.49708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002166  translation elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  666  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.48186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  81.31 
 
 
396 aa  668  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  7.05932e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  81.57 
 
 
396 aa  670  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4006  translation elongation factor Tu  94.4 
 
 
394 aa  730  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  3.5404e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0203  translation elongation factor Tu  94.4 
 
 
394 aa  730  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000670775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.96 
 
 
395 aa  642  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.52961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 
397 aa  646  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 
397 aa  643  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3827  translation elongation factor Tu  94.91 
 
 
394 aa  734  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000173466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0198  translation elongation factor Tu  94.91 
 
 
394 aa  734  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  9.64902e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3892  elongation factor Tu  96.69 
 
 
394 aa  746  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00189739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0319  elongation factor Tu  96.69 
 
 
394 aa  746  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  4.44857e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03809  hypothetical protein  93.64 
 
 
394 aa  728  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.41403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4070  elongation factor Tu  89.06 
 
 
394 aa  679  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21217e-07  normal  0.0221008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>