123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3799 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  56.52 
 
 
209 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  55.92 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  55.92 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  56.04 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  41.36 
 
 
210 aa  141  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
229 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  34.26 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
225 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 
228 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  32.57 
 
 
267 aa  92  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  32.34 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  32 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  36.72 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.6 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  23.61 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  27.4 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  24.07 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.86 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.49 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  27.93 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  32.43 
 
 
294 aa  58.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  29.44 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.68 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  25.37 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
222 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  24.88 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  30.57 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.59 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.04 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  24.88 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.62 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  26.54 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  26.78 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  30.9 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.21 
 
 
282 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  34.45 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  28.31 
 
 
202 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.23 
 
 
257 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  30.23 
 
 
257 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  25.62 
 
 
291 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.72 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.47 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  27.52 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  25.97 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  25.69 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
308 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  26.11 
 
 
158 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.03 
 
 
321 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  25.5 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  25.65 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  24.41 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.88 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  24.73 
 
 
218 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  27.27 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.57 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  28.57 
 
 
289 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  26.78 
 
 
216 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.59 
 
 
294 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  28.75 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  29.47 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  30.53 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.28 
 
 
300 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
301 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  33.81 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  29.47 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  26.35 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08271  hypothetical protein  39.29 
 
 
72 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>