More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3586 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  99.15 
 
 
353 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
386 aa  776    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  99.48 
 
 
386 aa  775    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  68.54 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  64.62 
 
 
373 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  64.62 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2512  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.23 
 
 
383 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.98 
 
 
379 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  53.7 
 
 
392 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  55.53 
 
 
386 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  51.92 
 
 
404 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.49 
 
 
399 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.69 
 
 
386 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  52.57 
 
 
423 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  56.16 
 
 
394 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  52.33 
 
 
428 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.79 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  53.55 
 
 
400 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  51.48 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  52.65 
 
 
382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  49.32 
 
 
405 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 
422 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
395 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  50 
 
 
395 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  50 
 
 
388 aa  348  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  50.69 
 
 
397 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  53.69 
 
 
400 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.73 
 
 
433 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  54.08 
 
 
384 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.26 
 
 
381 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  50.26 
 
 
381 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  53.65 
 
 
384 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  51.19 
 
 
382 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.05 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  49.86 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  51.19 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  56.25 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  48.56 
 
 
397 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  49.74 
 
 
381 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  51.19 
 
 
382 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 
395 aa  342  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  51.63 
 
 
383 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  55.29 
 
 
378 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  51.36 
 
 
442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  53.41 
 
 
387 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  50.13 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  51.64 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  53.22 
 
 
409 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.06 
 
 
386 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 
418 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  52.24 
 
 
383 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  49.86 
 
 
418 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 
418 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  47.12 
 
 
379 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.59 
 
 
398 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  53.39 
 
 
383 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  55.02 
 
 
395 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.14 
 
 
397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  49.86 
 
 
385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  54.2 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  49.05 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  49.86 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  49.86 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.58 
 
 
393 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  49.86 
 
 
385 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 
415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  49.58 
 
 
385 aa  325  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  47.81 
 
 
397 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  49.58 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  49.58 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  48.51 
 
 
409 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.52 
 
 
405 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  48.51 
 
 
409 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  50.52 
 
 
386 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  49.32 
 
 
405 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  48.76 
 
 
386 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  48.65 
 
 
385 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  48.24 
 
 
409 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  48.24 
 
 
397 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.24 
 
 
397 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  48.24 
 
 
397 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  49.59 
 
 
431 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  48.24 
 
 
397 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  48.24 
 
 
397 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  48.24 
 
 
397 aa  322  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  49.58 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  48.65 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  48.65 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  48.65 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.96 
 
 
403 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  49.21 
 
 
426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  48.92 
 
 
424 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  48.92 
 
 
424 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  48.92 
 
 
424 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 
450 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.72 
 
 
396 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>