More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3446 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3446  diadenosine tetraphosphatase  100 
 
 
289 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3575  diadenosine tetraphosphatase  99.31 
 
 
289 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0774  diadenosine tetraphosphatase  98.96 
 
 
289 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0469096  normal  0.0479876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0722  diadenosine tetraphosphatase  88.81 
 
 
283 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3637  diadenosine tetraphosphatase  82.33 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  80.83 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  81.2 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  81.2 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  81.2 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  81.2 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  81.2 
 
 
282 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  79.7 
 
 
281 aa  461  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3834  diadenosine tetraphosphatase  76.26 
 
 
281 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00053  diadenosinetetraphosphatase  80.45 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3550  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  80.45 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0054  diadenosine tetraphosphatase  80.45 
 
 
282 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257316  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0043  diadenosine tetraphosphatase  80.45 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0053  diadenosine tetraphosphatase  80.45 
 
 
282 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.627509  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0055  diadenosine tetraphosphatase  80.45 
 
 
280 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3606  diadenosine tetraphosphatase  80.45 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00052  hypothetical protein  80.45 
 
 
280 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0053  diadenosine tetraphosphatase  80.45 
 
 
280 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0296879  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0600  diadenosine tetraphosphatase  76.75 
 
 
280 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0562  diadenosine tetraphosphatase  69.85 
 
 
288 aa  397  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  54.44 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  52.96 
 
 
268 aa  308  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  54.78 
 
 
269 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1558  diadenosine tetraphosphatase  51.85 
 
 
273 aa  300  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  50 
 
 
276 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0367  diadenosine tetraphosphatase  53.85 
 
 
273 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  50.54 
 
 
275 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4527  diadenosine tetraphosphatase  48.23 
 
 
285 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3211  diadenosine tetraphosphatase  47.43 
 
 
274 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.878337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3641  diadenosine tetraphosphatase  46.69 
 
 
274 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3117  diadenosine tetraphosphatase  47.06 
 
 
274 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1077  diadenosine tetraphosphatase  45.96 
 
 
274 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0975  diadenosine tetraphosphatase  45.96 
 
 
274 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1044  diadenosine tetraphosphatase  45.96 
 
 
274 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0903  diadenosine tetraphosphatase  46.69 
 
 
274 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  50.19 
 
 
283 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2821  diadenosine tetraphosphatase  47.23 
 
 
270 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3315  diadenosine tetraphosphatase  45.59 
 
 
274 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2728  diadenosine tetraphosphatase  49.81 
 
 
270 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  50.97 
 
 
272 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0877  diadenosine tetraphosphatase  47.06 
 
 
274 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0987  diadenosine tetraphosphatase  44.49 
 
 
274 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.341125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  49.03 
 
 
283 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0430  diadenosine tetraphosphatase  49.62 
 
 
288 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213762  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3506  diadenosine tetraphosphatase  49.61 
 
 
267 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  52.14 
 
 
278 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4803  diadenosine tetraphosphatase  49.06 
 
 
288 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0962  diadenosine tetraphosphatase  47.79 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  49.81 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3081  diadenosine tetraphosphatase  46.1 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  47.84 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46850  diadenosine tetraphosphatase  49.24 
 
 
277 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1345  diadenosine tetraphosphatase  48.45 
 
 
278 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.399511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0735  diadenosine tetraphosphatase  47.92 
 
 
271 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1983  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  49.62 
 
 
275 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0467  diadenosine tetraphosphatase  46.59 
 
 
277 aa  248  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0215595  normal  0.520135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0922  diadenosine tetraphosphatase  47.62 
 
 
272 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0753757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0549  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase, symmetrical  47.86 
 
 
300 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1012  diadenosine tetraphosphatase  44.85 
 
 
274 aa  245  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493467  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 
288 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0433  diadenosine tetraphosphatase  46.21 
 
 
288 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4629  diadenosine tetraphosphatase  47.47 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  45.83 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0860  diadenosine tetraphosphatase  43.01 
 
 
277 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  46.35 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  45.45 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03416  diadenosine tetraphosphatase  46.54 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0436512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2890  diadenosine tetraphosphatase  45.52 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.312502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1064  diadenosine tetraphosphatase  48.08 
 
 
281 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.512077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2993  diadenosine tetraphosphatase  46.99 
 
 
276 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2853  diadenosine tetraphosphatase  47.37 
 
 
276 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  43.96 
 
 
273 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1143  diadenosine tetraphosphatase  47.69 
 
 
281 aa  228  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281223  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  48.31 
 
 
278 aa  228  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.91 
 
 
287 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
279 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  44.44 
 
 
282 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  45.08 
 
 
265 aa  225  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1149  diadenosine tetraphosphatase  43.21 
 
 
280 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  45.1 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0908  diadenosine tetraphosphatase  44.28 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140647  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1354  diadenosine tetraphosphatase  43.3 
 
 
294 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1290  diadenosine tetraphosphatase  43.3 
 
 
295 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  43.85 
 
 
272 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3423  diadenosine tetraphosphatase  40.46 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0666  diadenosine tetraphosphatase  42.91 
 
 
344 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3968  diadenosine tetraphosphatase  43.87 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383712  normal  0.638877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  43.13 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2736  diadenosine tetraphosphatase  43.97 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0760  diadenosine tetraphosphatase  43.25 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  45.17 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1468  diadenosine tetraphosphatase  45.31 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.85659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  44.23 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0841  diadenosine tetraphosphatase  43.87 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04647  diadenosine tetraphosphatase  44.06 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.242571  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0743  diadenosine tetraphosphatase  43.87 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>