More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3430 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  43.9 
 
 
865 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  42.87 
 
 
916 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  44.5 
 
 
887 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  42.44 
 
 
887 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  45.48 
 
 
893 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.34 
 
 
908 aa  641    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.84 
 
 
906 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  42.79 
 
 
905 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1037  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  49.51 
 
 
889 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  44.83 
 
 
879 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.92 
 
 
904 aa  684    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.64 
 
 
884 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  44.72 
 
 
889 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  44.34 
 
 
867 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  43.56 
 
 
928 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  44.53 
 
 
902 aa  711    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  99.88 
 
 
862 aa  1763    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  44.42 
 
 
895 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  42.96 
 
 
889 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  46.58 
 
 
888 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  44.3 
 
 
918 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2080  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.4 
 
 
956 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  43.22 
 
 
882 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  42.62 
 
 
891 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.86 
 
 
903 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  45.87 
 
 
889 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.75 
 
 
884 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  45.85 
 
 
893 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  45.97 
 
 
887 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  42.96 
 
 
889 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  42.74 
 
 
885 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.6 
 
 
887 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  42.74 
 
 
885 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  44.26 
 
 
918 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  46.69 
 
 
885 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1895  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.84 
 
 
947 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  43.66 
 
 
887 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  42.96 
 
 
889 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  44.15 
 
 
900 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  44.82 
 
 
916 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.71 
 
 
879 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  44.07 
 
 
889 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  42.7 
 
 
893 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  44.37 
 
 
865 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.87 
 
 
909 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  42.96 
 
 
889 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.58 
 
 
888 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.86 
 
 
884 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0706  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.4 
 
 
956 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.7 
 
 
888 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  44.3 
 
 
895 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0795  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.4 
 
 
956 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  100 
 
 
867 aa  1774    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  46.11 
 
 
889 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  45.57 
 
 
897 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  44.42 
 
 
902 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  44.71 
 
 
879 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  44.02 
 
 
906 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  44.85 
 
 
886 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.48 
 
 
869 aa  682    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  42.96 
 
 
889 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  43.67 
 
 
901 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.53 
 
 
898 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0742  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.51 
 
 
889 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.64 
 
 
884 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  44.04 
 
 
878 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  42.56 
 
 
897 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  41.67 
 
 
897 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  42.56 
 
 
897 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  40.77 
 
 
899 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  42.49 
 
 
889 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  41.47 
 
 
889 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  42.36 
 
 
889 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  42.37 
 
 
889 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  42.37 
 
 
889 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  44.04 
 
 
865 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  42.14 
 
 
889 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  41.99 
 
 
913 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  41.34 
 
 
872 aa  625  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  43.01 
 
 
855 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  40.41 
 
 
868 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  41.28 
 
 
884 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.94 
 
 
910 aa  617  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  42.66 
 
 
902 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  44.01 
 
 
915 aa  619  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.01 
 
 
891 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  41.39 
 
 
898 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  41.63 
 
 
880 aa  598  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  41.1 
 
 
884 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  41.64 
 
 
880 aa  598  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  41.47 
 
 
881 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  41.46 
 
 
880 aa  595  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  43.84 
 
 
842 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  40.09 
 
 
909 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  40.75 
 
 
882 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  42.76 
 
 
846 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  40.75 
 
 
882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  44.97 
 
 
849 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  39.08 
 
 
894 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  41.59 
 
 
899 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>