More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3090 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  80.69 
 
 
787 aa  1293  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  64.56 
 
 
807 aa  1021  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  64.26 
 
 
823 aa  1030  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  69.36 
 
 
804 aa  1099  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  69.05 
 
 
807 aa  1086  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  90.94 
 
 
784 aa  1451  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.16404e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  49.8 
 
 
830 aa  777  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  69.71 
 
 
805 aa  1086  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  64.34 
 
 
804 aa  1012  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  63.95 
 
 
823 aa  1013  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  69.45 
 
 
807 aa  1075  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  66.93 
 
 
810 aa  1044  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  68.68 
 
 
805 aa  1056  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  63.57 
 
 
823 aa  996  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  64.03 
 
 
806 aa  1010  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  69.45 
 
 
807 aa  1075  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  79.9 
 
 
785 aa  1298  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.02601e-05  hitchhiker  7.06703e-06 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  49.22 
 
 
800 aa  744  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.70632e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  46.27 
 
 
772 aa  674  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  49.68 
 
 
816 aa  780  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  67.1 
 
 
811 aa  1064  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  1.89689e-08 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  45.81 
 
 
788 aa  662  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  3.9605e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  90.94 
 
 
784 aa  1454  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  90.94 
 
 
784 aa  1454  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.188e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  57.79 
 
 
806 aa  914  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  45.31 
 
 
794 aa  687  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  49.94 
 
 
816 aa  792  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  59.9 
 
 
819 aa  924  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  46.78 
 
 
835 aa  705  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02983  ATP-dependent protease La  77.91 
 
 
809 aa  807  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00208912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  47.99 
 
 
807 aa  742  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  90.94 
 
 
784 aa  1454  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  90.94 
 
 
784 aa  1454  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  90.82 
 
 
784 aa  1452  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  64.36 
 
 
816 aa  1031  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  63.95 
 
 
810 aa  1014  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  63.37 
 
 
808 aa  1004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  68.54 
 
 
798 aa  1070  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  91.07 
 
 
784 aa  1454  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.67472e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  54.41 
 
 
811 aa  858  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  48.89 
 
 
820 aa  766  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.43 
 
 
817 aa  682  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.82753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  79.77 
 
 
785 aa  1296  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.48642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  95.03 
 
 
784 aa  1524  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.12483e-07  hitchhiker  7.16976e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  79.39 
 
 
781 aa  1297  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.52333e-05  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  91.07 
 
 
784 aa  1454  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.37635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  91.07 
 
 
784 aa  1454  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.29427e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  80.1 
 
 
783 aa  1298  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  47.22 
 
 
836 aa  764  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  46.05 
 
 
802 aa  658  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  46.84 
 
 
786 aa  716  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0754  ATP-dependent endopeptidase Lon  63.46 
 
 
817 aa  994  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  64.61 
 
 
805 aa  1016  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  64.78 
 
 
818 aa  1032  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  47.04 
 
 
810 aa  681  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  60.26 
 
 
802 aa  941  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  45.67 
 
 
810 aa  695  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  45.41 
 
 
815 aa  679  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  47.51 
 
 
787 aa  667  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  91.07 
 
 
784 aa  1454  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.24307e-06  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  99.87 
 
 
784 aa  1597  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  55.77 
 
 
797 aa  899  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  60.73 
 
 
799 aa  958  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  68.41 
 
 
798 aa  1069  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  52.01 
 
 
778 aa  819  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  53.06 
 
 
773 aa  842  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  64.69 
 
 
806 aa  1016  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  99.87 
 
 
784 aa  1597  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.01207e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  63.59 
 
 
817 aa  998  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  69.84 
 
 
808 aa  1080  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  68.18 
 
 
804 aa  1066  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 
809 aa  703  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  80.15 
 
 
785 aa  1299  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.14531e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  49.93 
 
 
815 aa  770  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  100 
 
 
784 aa  1599  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.93102e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  45.2 
 
 
816 aa  686  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  55.83 
 
 
797 aa  873  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  48.49 
 
 
825 aa  771  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  54.73 
 
 
815 aa  863  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  56.09 
 
 
806 aa  900  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  53.21 
 
 
811 aa  839  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0201  ATP-dependent protease La  52.58 
 
 
815 aa  814  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  47.56 
 
 
804 aa  719  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  9.30171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  44.24 
 
 
800 aa  659  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  46.96 
 
 
833 aa  710  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  44.86 
 
 
825 aa  681  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  57.54 
 
 
806 aa  909  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 
794 aa  685  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.93647e-11 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  50.06 
 
 
817 aa  796  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  92.71 
 
 
793 aa  1494  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  91.12 
 
 
787 aa  1467  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  91.07 
 
 
784 aa  1454  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  54.27 
 
 
775 aa  860  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  92.46 
 
 
793 aa  1491  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  66.24 
 
 
810 aa  1056  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  46.77 
 
 
817 aa  716  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  50.65 
 
 
793 aa  751  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  45.88 
 
 
815 aa  700  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  2.34366e-07  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  50.64 
 
 
793 aa  749  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  67.4 
 
 
821 aa  1078  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>