More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3069 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3069  50S ribosomal protein L31 type B  100 
 
 
86 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3210  50S ribosomal protein L31 type B  100 
 
 
86 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.21359e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1125  50S ribosomal protein L31 type B  78.05 
 
 
85 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.13817e-11  unclonable  9.42965e-09 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1068  50S ribosomal protein L31 type B  75.31 
 
 
82 aa  132  1e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.788899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0934  50S ribosomal protein L31 type B  72.62 
 
 
86 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.626009  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3243  50S ribosomal protein L31 type B  75.31 
 
 
82 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3049  ribosomal protein L31  71.6 
 
 
83 aa  128  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0096084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0307  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
88 aa  126  8e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0324  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
87 aa  126  8e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.77542e-07  normal  0.105012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3323  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
88 aa  126  8e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0342  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
87 aa  126  8e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.46982e-08  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00255  50S ribosomal protein L31  69.05 
 
 
87 aa  126  8e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3308  ribosomal protein L31  69.05 
 
 
88 aa  126  8e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00259  hypothetical protein  69.05 
 
 
87 aa  126  8e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0350  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
87 aa  126  1e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.380768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1330  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
87 aa  125  2e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0513  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  8.62456e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0519  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  8.07514e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0572  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.09975e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0529  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.96903e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0510  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  5.10204e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002727  LSU ribosomal protein L31p  68.24 
 
 
86 aa  120  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0694209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03250  50S ribosomal protein L31 type B  64.71 
 
 
86 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0402  50S ribosomal protein L31 type B  62.5 
 
 
85 aa  112  2e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.44485e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4183  ribosomal protein L31  64.2 
 
 
93 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3920  50S ribosomal protein L31 type B  62.96 
 
 
93 aa  110  7e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17700  50S ribosomal protein L31 type B  60 
 
 
87 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.11738e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1540  50S ribosomal protein L31 type B  58.82 
 
 
87 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.267597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0890  50S ribosomal protein L31 type B  55.95 
 
 
85 aa  103  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1916  50S ribosomal protein L31 type B  52.38 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  2.48892e-09  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0507  50S ribosomal protein L31 type B  53.75 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  8.69204e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2207  50S ribosomal protein L31 type B  53.75 
 
 
93 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240279  normal  0.0216072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2137  50S ribosomal protein L31P  51.85 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171095  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2120  50S ribosomal protein L31 type B  50.6 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6358  ribosomal protein L31  50.63 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2291  50S ribosomal protein L31P  51.9 
 
 
80 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.43826e-07  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0263  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
83 aa  83.2  1e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1117  50S ribosomal protein L31 type B  46.99 
 
 
86 aa  82.8  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0238519  normal  0.245393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1025  50S ribosomal protein L31 type B  46.99 
 
 
86 aa  82.8  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.010082  normal  0.336183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2127  50S ribosomal protein L31 type B  47.06 
 
 
85 aa  83.2  1e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.029329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1878  50S ribosomal protein L31 type B  47.06 
 
 
85 aa  82.4  2e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1703  50S ribosomal protein L31 type B  50.63 
 
 
81 aa  81.6  3e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  3.92946e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1440  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
87 aa  82  3e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219049  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
86 aa  81.3  4e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6246  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
88 aa  80.5  6e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235977  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1784  50S ribosomal protein L31P  46.15 
 
 
80 aa  80.9  6e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  5.81965e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1833  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
88 aa  80.5  6e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.012708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
87 aa  80.9  6e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1857  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
88 aa  80.5  6e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316845  normal  0.0801388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1182  50S ribosomal protein L31 type B  48.75 
 
 
87 aa  80.5  7e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000836731  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2367  50S ribosomal protein L31 type B  47.06 
 
 
88 aa  80.5  7e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0489  50S ribosomal protein L31P  51.28 
 
 
80 aa  80.5  7e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1820  50S ribosomal protein L31 type B  47.62 
 
 
88 aa  80.5  8e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0400323 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0873  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
80 aa  79.7  1e-14  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00543783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2213  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
87 aa  79.7  1e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1727  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
85 aa  79.3  1e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  8.29629e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0947  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  79.3  2e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal  0.576162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3254  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
80 aa  79  2e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0787  50S ribosomal protein L31 type B  47.44 
 
 
80 aa  79  2e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0786  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
80 aa  78.6  2e-14  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2751  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
84 aa  79.3  2e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.178212  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1771  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  78.6  3e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1744  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  78.6  3e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372125  normal  0.163182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0637  50S ribosomal protein L31 type B  48.75 
 
 
115 aa  78.2  3e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2194  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
84 aa  78.6  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0620281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1654  50S ribosomal protein L31P  61.9 
 
 
89 aa  78.6  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2857  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
86 aa  78.6  3e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2156  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
84 aa  78.6  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5134  50S ribosomal protein L31 type B  47.44 
 
 
86 aa  77.8  4e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593671  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
81 aa  78.2  4e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.64047e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7574  ribosomal protein L31  49.37 
 
 
81 aa  77.8  4e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0923  ribosomal protein L31  48.05 
 
 
85 aa  77.4  6e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.587387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77.4  7e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.88465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77.4  7e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.23612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  7.68356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77.4  7e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77.4  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2380  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  76.6  9e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.31175e-10  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0037  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1860  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2215  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77  9e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.43327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1369  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00759194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  77  9e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1131  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2253  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
87 aa  77  9e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.081991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3289  ribosomal protein L31  42.5 
 
 
87 aa  76.3  1e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5129  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
81 aa  76.3  1e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.7521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02360  50S ribosomal protein L31 type B  43.04 
 
 
80 aa  75.9  2e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1539  50S ribosomal protein L31 type B  46.91 
 
 
83 aa  75.1  3e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2094  ribosomal protein L31  45.57 
 
 
81 aa  75.1  3e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00123067  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1309  50S ribosomal protein L31 type B  46.25 
 
 
115 aa  75.5  3e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0450  50S ribosomal protein L31 type B  42.5 
 
 
88 aa  74.7  4e-13  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000490006  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0758  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  73.9  7e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1557  ribosomal protein L31  47.44 
 
 
82 aa  73.6  8e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0965465  decreased coverage  0.00916576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2901  50S ribosomal protein L31 type B  45.57 
 
 
87 aa  72.4  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11228  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 
93 aa  72  2e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0592  50S ribosomal protein L31 type B  44.71 
 
 
85 aa  72.4  2e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>