180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2901 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  100 
 
 
175 aa  360  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  100 
 
 
175 aa  360  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  100 
 
 
175 aa  360  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  4.60147e-12  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  91.38 
 
 
176 aa  335  2e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  91.38 
 
 
176 aa  335  2e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.85932e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  91.38 
 
 
176 aa  335  2e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.89352e-10  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  91.38 
 
 
176 aa  335  2e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.7596e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  91.38 
 
 
176 aa  335  2e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  91.38 
 
 
176 aa  335  2e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.83626e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  90.86 
 
 
215 aa  333  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  90.86 
 
 
215 aa  333  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8988e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  90.86 
 
 
215 aa  333  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.98248e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  89.66 
 
 
176 aa  330  7e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  4.48874e-05  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  89.66 
 
 
176 aa  330  7e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.55637e-05  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  89.66 
 
 
209 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  4.1401e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  89.66 
 
 
209 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.67228e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  89.66 
 
 
209 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.5287e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  89.08 
 
 
176 aa  328  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.81933e-08  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  88.27 
 
 
179 aa  326  1e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.41409e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  86.29 
 
 
175 aa  322  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  3.47924e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  85.71 
 
 
175 aa  321  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.63354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  86.86 
 
 
175 aa  318  2e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  86.21 
 
 
175 aa  317  4e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  76.88 
 
 
174 aa  291  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  76.3 
 
 
175 aa  288  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  6.71882e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  76.88 
 
 
175 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.46735e-08  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  77.33 
 
 
175 aa  287  5e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.09985e-07  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  77.33 
 
 
175 aa  287  5e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.59174e-09  decreased coverage  6.40703e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  77.33 
 
 
175 aa  287  5e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.19946e-09  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  76.88 
 
 
175 aa  286  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  75.14 
 
 
175 aa  286  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.79628e-09  unclonable  1.89702e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  76.3 
 
 
174 aa  286  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  76.3 
 
 
175 aa  286  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.40867e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  75.72 
 
 
175 aa  284  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.7082e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  75.72 
 
 
175 aa  284  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.2046e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  75.72 
 
 
175 aa  284  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  75.72 
 
 
175 aa  284  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  5.03169e-10  decreased coverage  3.44478e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  75.72 
 
 
175 aa  284  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.5331e-08  unclonable  4.16512e-06 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  74.57 
 
 
175 aa  282  2e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  73.41 
 
 
175 aa  281  4e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.90222e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  73.99 
 
 
175 aa  280  6e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  6.4376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  74.58 
 
 
177 aa  279  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.70149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  73.41 
 
 
175 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.83187e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  73.41 
 
 
174 aa  278  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  73.45 
 
 
177 aa  278  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  73.99 
 
 
175 aa  275  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.83381e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  72.41 
 
 
176 aa  272  1e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.57919e-08  hitchhiker  7.35026e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  71.68 
 
 
175 aa  269  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  66.86 
 
 
174 aa  249  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0095  flavodoxin  72.02 
 
 
176 aa  244  6e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  52.05 
 
 
171 aa  194  5e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  51.76 
 
 
194 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  49.11 
 
 
169 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  46.2 
 
 
170 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  44.44 
 
 
170 aa  163  1e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  44.12 
 
 
198 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3303  flavodoxin FldB  43.37 
 
 
172 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  42.77 
 
 
172 aa  154  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  42.77 
 
 
172 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0642  flavodoxin FldB  43.37 
 
 
172 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  42.17 
 
 
172 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  42.51 
 
 
224 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  43.45 
 
 
168 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  42.51 
 
 
172 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  39.16 
 
 
172 aa  152  3e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3305  flavodoxin FldB  43.98 
 
 
172 aa  151  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133036  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  44.89 
 
 
177 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  45.73 
 
 
168 aa  151  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  40.72 
 
 
173 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0856  flavodoxin FldB  41.57 
 
 
172 aa  150  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  43.11 
 
 
169 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  42.94 
 
 
176 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3893  flavodoxin FldB  40.96 
 
 
200 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.410227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3213  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3279  flavodoxin FldB  40.83 
 
 
192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3276  flavodoxin FldB  41.32 
 
 
173 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3201  flavodoxin FldB  40.83 
 
 
192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3381  flavodoxin FldB  40.83 
 
 
192 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  43.33 
 
 
180 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  43.2 
 
 
168 aa  147  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  8.06437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  42.07 
 
 
168 aa  146  1e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  41.92 
 
 
178 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  44.57 
 
 
176 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  41.21 
 
 
172 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  42.35 
 
 
178 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  40.74 
 
 
172 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  42.05 
 
 
176 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  42.68 
 
 
168 aa  139  2e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  40.91 
 
 
178 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  39.18 
 
 
182 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  41.86 
 
 
171 aa  135  3e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>