More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2596 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  72.09 
 
 
837 aa  723  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.71124e-05  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.58 
 
 
837 aa  711  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  4.38856e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.63 
 
 
850 aa  733  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.81786e-05  hitchhiker  8.25037e-07 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1186  DNA translocase FtsK  62.4 
 
 
903 aa  643  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00816417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  72.02 
 
 
914 aa  739  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.18677e-05  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  71.83 
 
 
913 aa  737  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  85.02 
 
 
1310 aa  889  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.85986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  73.37 
 
 
960 aa  757  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.21086e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.88 
 
 
896 aa  738  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.46975e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  83.05 
 
 
1244 aa  892  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.86 
 
 
841 aa  715  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  2.74809e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  85.99 
 
 
1360 aa  874  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  85.99 
 
 
1379 aa  873  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  85.02 
 
 
1369 aa  891  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.23505e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  85.02 
 
 
1329 aa  889  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  62.7 
 
 
1187 aa  1481  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  60.03 
 
 
1085 aa  654  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.98 
 
 
849 aa  724  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.84 
 
 
932 aa  744  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.55833e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  85.02 
 
 
1368 aa  890  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.42338e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  85.02 
 
 
1329 aa  889  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.12407e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.83 
 
 
917 aa  738  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  66.84 
 
 
1120 aa  776  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  100 
 
 
1310 aa  2674  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.51266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.83 
 
 
917 aa  738  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.27747e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  98.78 
 
 
1299 aa  2533  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  99.69 
 
 
1310 aa  2662  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  85.99 
 
 
1358 aa  874  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  72.02 
 
 
917 aa  738  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.03772e-05  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.23 
 
 
884 aa  728  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.83 
 
 
917 aa  738  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.52872e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  85.02 
 
 
1342 aa  890  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  73.03 
 
 
1091 aa  776  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  87.21 
 
 
1174 aa  910  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  71.43 
 
 
911 aa  734  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  71.03 
 
 
879 aa  742  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.83 
 
 
917 aa  738  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.09 
 
 
866 aa  655  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  85.99 
 
 
1360 aa  874  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.97 
 
 
1202 aa  1036  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.74 
 
 
1157 aa  1424  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  85.02 
 
 
1342 aa  890  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  85.02 
 
 
1329 aa  890  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  73.43 
 
 
1014 aa  772  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  70.57 
 
 
928 aa  762  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  64.96 
 
 
855 aa  679  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  85.99 
 
 
1321 aa  874  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.71 
 
 
1145 aa  1387  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  62.8 
 
 
782 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  64 
 
 
794 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.19 
 
 
789 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  7.83388e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  65.11 
 
 
973 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  64.44 
 
 
789 aa  632  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60 
 
 
786 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  61.38 
 
 
801 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  63.6 
 
 
794 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.78 
 
 
786 aa  627  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  60.75 
 
 
801 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.23 
 
 
917 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  9.48051e-12 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  64.63 
 
 
802 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  61.63 
 
 
786 aa  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  61.63 
 
 
786 aa  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.29 
 
 
1707 aa  621  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  64.49 
 
 
1673 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.77 
 
 
908 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.67 
 
 
784 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.77 
 
 
908 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.5 
 
 
1527 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.23 
 
 
831 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  63.89 
 
 
777 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.29 
 
 
1640 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.5 
 
 
1527 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  64.1 
 
 
1123 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.29 
 
 
1610 aa  618  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  63.62 
 
 
769 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.17 
 
 
770 aa  618  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  60.45 
 
 
776 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  59.48 
 
 
784 aa  619  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.17 
 
 
807 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.97 
 
 
834 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  64.59 
 
 
765 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  64.17 
 
 
771 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  63.62 
 
 
1851 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  64.04 
 
 
811 aa  613  1e-174  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  63.62 
 
 
1851 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  63.71 
 
 
802 aa  614  1e-174  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  63.62 
 
 
1834 aa  613  1e-174  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  63.84 
 
 
775 aa  614  1e-174  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.45 
 
 
799 aa  613  1e-174  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.3 
 
 
1527 aa  615  1e-174  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.45 
 
 
776 aa  615  1e-174  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  62.52 
 
 
844 aa  613  1e-174  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  64.04 
 
 
804 aa  613  1e-174  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  63.62 
 
 
822 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  63.62 
 
 
822 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  63.62 
 
 
1725 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  63.62 
 
 
822 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  63.62 
 
 
1725 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  63.62 
 
 
768 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  63.62 
 
 
1725 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>