More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2551 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  56.4 
 
 
647 aa  707  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  64.06 
 
 
639 aa  811  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  77.24 
 
 
635 aa  975  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.77813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  77.39 
 
 
635 aa  977  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.87784e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  56.19 
 
 
638 aa  701  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  84.93 
 
 
634 aa  1103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  4.34555e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  56.74 
 
 
645 aa  697  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  58.16 
 
 
641 aa  729  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  99.84 
 
 
637 aa  1303  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  65.36 
 
 
644 aa  768  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  77.71 
 
 
635 aa  994  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.10719e-06  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  57.1 
 
 
639 aa  705  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  77.08 
 
 
635 aa  974  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  100 
 
 
637 aa  1303  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  58.01 
 
 
641 aa  728  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  64.45 
 
 
639 aa  816  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  58.19 
 
 
640 aa  735  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  57.88 
 
 
640 aa  732  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  56.9 
 
 
638 aa  707  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  57.88 
 
 
640 aa  730  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  59.03 
 
 
640 aa  735  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.65711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  57.14 
 
 
638 aa  714  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  59.97 
 
 
638 aa  734  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  77.24 
 
 
635 aa  975  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  58.16 
 
 
641 aa  729  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  58.69 
 
 
639 aa  695  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.85056e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  78.49 
 
 
635 aa  1026  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  57.92 
 
 
641 aa  730  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  100 
 
 
637 aa  1303  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  77.46 
 
 
635 aa  982  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  77.24 
 
 
635 aa  975  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
646 aa  692  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  77.62 
 
 
635 aa  985  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  77.62 
 
 
635 aa  986  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  64.04 
 
 
636 aa  789  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  77.39 
 
 
635 aa  984  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  54.19 
 
 
645 aa  697  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  58.16 
 
 
641 aa  729  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  79.28 
 
 
637 aa  1025  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  78.12 
 
 
649 aa  1025  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  81.49 
 
 
642 aa  1036  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  77.24 
 
 
635 aa  975  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  77.24 
 
 
635 aa  975  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  64.06 
 
 
639 aa  820  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  58.03 
 
 
640 aa  729  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  77.62 
 
 
635 aa  986  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  81.48 
 
 
636 aa  1032  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  77.62 
 
 
635 aa  986  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  52.21 
 
 
631 aa  602  1e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  48.44 
 
 
642 aa  597  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  49.24 
 
 
640 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  50 
 
 
650 aa  585  1e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  50 
 
 
623 aa  584  1e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  51.38 
 
 
642 aa  585  1e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  47.98 
 
 
643 aa  583  1e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  48.82 
 
 
635 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17313e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  49.92 
 
 
627 aa  576  1e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.2 
 
 
653 aa  576  1e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  49.31 
 
 
645 aa  578  1e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 
642 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  48.67 
 
 
636 aa  575  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  46.17 
 
 
632 aa  573  1e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  51.38 
 
 
642 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  48.35 
 
 
663 aa  572  1e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  51.23 
 
 
642 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  46.63 
 
 
649 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  47.9 
 
 
642 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 
636 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 
633 aa  568  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  45.77 
 
 
640 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  49.45 
 
 
632 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  46.32 
 
 
661 aa  565  1e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  46.32 
 
 
649 aa  565  1e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  46.32 
 
 
661 aa  565  1e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  47.03 
 
 
641 aa  565  1e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 
615 aa  563  1e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  46 
 
 
649 aa  562  1e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 
636 aa  562  1e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  46.21 
 
 
645 aa  564  1e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
648 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  46.14 
 
 
641 aa  561  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  46.19 
 
 
648 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  46.15 
 
 
649 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  47.34 
 
 
641 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  50.78 
 
 
636 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  45.54 
 
 
648 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 
637 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.14394e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
660 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
660 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
648 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  46.85 
 
 
688 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
648 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
660 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
648 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  45.88 
 
 
648 aa  554  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  50.78 
 
 
641 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  49.06 
 
 
625 aa  555  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  51.01 
 
 
640 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 
1065 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  49.84 
 
 
639 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>