45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2548 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  99.48 
 
 
192 aa  386  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  73.3 
 
 
185 aa  290  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  72.87 
 
 
182 aa  284  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  72.87 
 
 
182 aa  284  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  63.3 
 
 
188 aa  238  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  58.33 
 
 
188 aa  234  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  61.7 
 
 
188 aa  233  2e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  57.29 
 
 
187 aa  227  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  57.29 
 
 
187 aa  227  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  57.29 
 
 
187 aa  227  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  57.29 
 
 
187 aa  227  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  56.77 
 
 
187 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  57.29 
 
 
187 aa  223  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  57.29 
 
 
187 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  57.29 
 
 
187 aa  222  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  57.29 
 
 
187 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  57.29 
 
 
187 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  57.29 
 
 
187 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  57.29 
 
 
187 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  57.84 
 
 
182 aa  215  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  57.84 
 
 
182 aa  215  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  49.47 
 
 
186 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  47.34 
 
 
185 aa  146  2e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  32.81 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  36.27 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  31.61 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  31.44 
 
 
192 aa  80.9  1e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  80.5  1e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  28.21 
 
 
192 aa  63.2  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  25.99 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  27.87 
 
 
191 aa  54.7  9e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  29.37 
 
 
198 aa  50.1  2e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  27.03 
 
 
211 aa  48.9  4e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  29.45 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  27.21 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  23.33 
 
 
241 aa  44.7  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  23.08 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  28.75 
 
 
238 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  24.76 
 
 
241 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  28.05 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  31.43 
 
 
201 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>