More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2407 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  949    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  99.58 
 
 		 474 aa  937    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  75.54 
 
 		 474 aa  710    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  76.94 
 
 		 478 aa  708    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  99.79 
 
 		 474 aa  940    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  75.32 
 
 		 476 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  74.14 
 
 		 502 aa  690    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  63.35 
 
 		 546 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  63.14 
 
 		 547 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  63.14 
 
 		 495 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  63.14 
 
 		 547 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  65.43 
 
 		 484 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  63.06 
 
 		 546 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  62.85 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  62.71 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  65.78 
 
 		 480 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  62.63 
 
 		 495 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.91 
 
 		 469 aa  189  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 475 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  26.12 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  27.13 
 
 		 446 aa  161  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  27.52 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 464 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 453 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  24.12 
 
 		 439 aa  126  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 452 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26.1 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.16 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.1 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25.58 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.23 
 
 		 439 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  24.78 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.27 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  26.56 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.17 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  25.59 
 
 		 429 aa  107  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  22.94 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.64 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  26 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  25.72 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  25.72 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  25.72 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  27.88 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  27.88 
 
 		 477 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  23.44 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  25.93 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  24.04 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  25 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  25.39 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  24 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>