266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2376 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  100 
 
 
279 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  100 
 
 
279 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  99.64 
 
 
279 aa  582  1e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  8.47833e-12  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  71.79 
 
 
273 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  2.38774e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  61.48 
 
 
276 aa  348  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.60079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  60.74 
 
 
276 aa  345  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  7.26719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  60.59 
 
 
274 aa  336  2e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  60 
 
 
269 aa  333  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  6.67026e-06  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  60 
 
 
269 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18014e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  60 
 
 
269 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.64083e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  60 
 
 
269 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.69097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  59.63 
 
 
269 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  59.63 
 
 
269 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  7.32176e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  59.63 
 
 
269 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  59.63 
 
 
269 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.58454e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  59.26 
 
 
269 aa  328  5e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.80084e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  53.7 
 
 
269 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  54.58 
 
 
275 aa  319  2e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  60.52 
 
 
269 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  60.89 
 
 
269 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  60.89 
 
 
269 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  60.89 
 
 
269 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  60.52 
 
 
269 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.29617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  51.97 
 
 
317 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  55.51 
 
 
278 aa  313  2e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  57.56 
 
 
270 aa  313  2e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  59.63 
 
 
286 aa  312  4e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  47.81 
 
 
273 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  45.76 
 
 
272 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  46.69 
 
 
268 aa  254  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  46.67 
 
 
271 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  45.56 
 
 
271 aa  252  5e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  45.93 
 
 
271 aa  250  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  46.72 
 
 
271 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.56407e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  45.56 
 
 
271 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.2625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  44.81 
 
 
274 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  45.36 
 
 
282 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  45.93 
 
 
271 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  45.56 
 
 
271 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  45.93 
 
 
271 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  43.7 
 
 
270 aa  244  1e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  48.15 
 
 
279 aa  242  4e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  45.02 
 
 
271 aa  241  8e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  44.81 
 
 
271 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  42.59 
 
 
277 aa  234  2e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  41.31 
 
 
282 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
282 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  39.19 
 
 
283 aa  184  2e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.1 
 
 
270 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.28 
 
 
269 aa  179  3e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.28 
 
 
270 aa  179  3e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  39.3 
 
 
267 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  37.89 
 
 
269 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  38.28 
 
 
267 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  37.05 
 
 
294 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  34.72 
 
 
290 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  38.06 
 
 
269 aa  174  1e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.11 
 
 
270 aa  174  1e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.11 
 
 
270 aa  173  2e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  37.89 
 
 
267 aa  174  2e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.11 
 
 
270 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.4 
 
 
283 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  40.25 
 
 
282 aa  164  1e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.94 
 
 
274 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.859e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.99 
 
 
320 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1113  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.73 
 
 
285 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  32.09 
 
 
271 aa  153  3e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.17 
 
 
294 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1230  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.86 
 
 
280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.706376  normal  0.528023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.5 
 
 
280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.53281  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.45 
 
 
285 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1197  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.86 
 
 
280 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1153  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  32.14 
 
 
280 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.010967  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.51 
 
 
313 aa  146  4e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0968  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.73 
 
 
277 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.56039e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1081  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.16 
 
 
298 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00250599  normal  0.0321173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2981  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.67 
 
 
279 aa  140  2e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.43248e-05  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1294  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  33.45 
 
 
275 aa  140  2e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1162  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.3 
 
 
292 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.32162e-05  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2899  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  31.67 
 
 
279 aa  139  4e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.19078e-09  hitchhiker  0.00146676 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  30.84 
 
 
313 aa  139  5e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3078  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  30.8 
 
 
279 aa  136  3e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.14385e-08  hitchhiker  7.17465e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  28.52 
 
 
274 aa  127  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  27.15 
 
 
302 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.09235e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.68 
 
 
309 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.84 
 
 
277 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.79 
 
 
279 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.8 
 
 
277 aa  118  1e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
285 aa  117  2e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  31.75 
 
 
326 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  32.4 
 
 
276 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1934  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
292 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11117e-06 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  24.64 
 
 
285 aa  111  1e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0560  methyltransferase  33.2 
 
 
289 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0832  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  25.99 
 
 
271 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.47805e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  27.64 
 
 
277 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  29.21 
 
 
302 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  26.09 
 
 
283 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
311 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  28.17 
 
 
280 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>